耕地低洼垫土是否合法，需视具体情况而定，主要取决于是否符合相关法律法规的规定以及是否获得了必要的审批手续。以下从不同角度为你详细分析：
一、合法垫土的情形
符合土地利用规划且获得审批：
- 如果耕地低洼垫土是为了改善土地条件，提高土地利用率，且该行为符合当地的土地利用总体规划和年度计划，同时已经获得了相关部门的审批手续（如土地管理部门的批准），那么这种垫土行为是合法的。
属于农田水利建设的一部分：
- 在某些情况下，耕地低洼垫土可能是农田水利建设的一部分，旨在改善农田的排水条件或灌溉条件。如果这种行为符合农田水利建设的规划和要求，并且已经获得了相关部门的批准，那么它也是合法的。
二、非法垫土的情形
未获得审批手续：
- 如果耕地低洼垫土行为没有获得相关部门的审批手续，即使是为了改善土地条件或提高土地利用率，也可能被视为非法行为。因为这种行为可能违反了土地管理法律法规中关于土地利用和审批的规定。
改变土地用途：
- 如果耕地低洼垫土后，土地用途发生了改变（如从耕地变为建设用地），且这种改变没有获得相关部门的批准，那么这种行为肯定是非法的。因为改变土地用途需要符合土地利用总体规划和年度计划，并经过严格的审批程序。
破坏生态环境：
- 如果耕地低洼垫土行为对生态环境造成了破坏（如导致水土流失、污染水源等），那么这种行为也是非法的。因为保护生态环境是法律法规的重要要求，任何破坏生态环境的行为都将受到法律的制裁。
三、法律后果与建议
- 法律后果：非法垫土行为可能面临土地管理部门的处罚，包括责令停止违法行为、限期改正、罚款等。如果情节严重，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
- 建议：在进行耕地低洼垫土行为前，建议先咨询当地土地管理部门或相关法律专业人士，了解相关法律法规和政策要求，确保行为合法合规。同时，要积极配合相关部门的审批工作，按照要求提交相关材料和证明文件。
如果你对耕地低洼垫土的合法性有进一步疑问，或者需要了解具体的审批流程和要求，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。