农村土地租赁后建厂房是否合法，需分情况讨论，主要取决于土地性质、租赁合同内容及是否履行了相关审批手续。以下从不同角度为您详细分析：
1. 土地性质是关键
- 农用地（如耕地、林地）：根据《土地管理法》第四十四条，农用地转为建设用地需依法办理农用地转用审批手续。若未办理，直接在农用地上建厂房属于违法用地，可能面临责令拆除、罚款等处罚。
- 建设用地（如宅基地、集体经营性建设用地）：若租赁的土地本身已规划为建设用地（如宅基地上的空闲地、集体经营性建设用地），且符合当地土地利用总体规划，则建厂房的合法性较高，但仍需履行建设审批手续（如规划许可、施工许可等）。
2. 租赁合同内容需合规
- 租赁合同应明确约定土地用途为“工业用途”或“建设厂房”，并约定双方权利义务（如租金、租赁期限、违约责任等）。若合同未明确用途或约定用途与实际不符，可能引发纠纷。
- 需注意：宅基地使用权原则上不得出租用于非农业建设（如建厂房），但若符合当地政策（如乡村振兴中的集体经营性建设用地入市），可能例外。
3. 审批手续必不可少
- 即使土地性质允许建厂房，也需履行以下手续：
- 规划许可：向当地自然资源部门申请《建设工程规划许可证》；
- 施工许可：向住建部门申请《建筑工程施工许可证》；
- 环保审批：若涉及污染，需通过环境影响评价审批；
- 消防验收：厂房建成后需通过消防验收。
- 未履行手续的后果：厂房可能被认定为“违章建筑”，面临强制拆除、罚款，甚至影响租赁合同效力。
4. 特殊情形：集体经营性建设用地入市
- 根据《土地管理法》第六十三条，符合规划的集体经营性建设用地，可经法定程序（如村民会议表决、乡（镇）政府审核、县级政府批准）后入市，用于工业、商业等经营性用途。此时租赁土地建厂房合法，但需签订书面合同并办理不动产登记。
法律建议
- 核查土地性质：向当地自然资源部门查询土地规划用途，确认是否允许建厂房。
- 完善租赁合同：明确约定土地用途、审批义务及违约责任，避免口头协议。
- 依法履行手续：主动办理规划、施工、环保等审批，确保厂房合法性。
- 咨询当地政策：部分地区对农村土地利用有特殊规定（如“点状供地”、乡村振兴项目），需结合政策操作。
若您已租赁土地并计划建厂房，建议立即停止施工，先确认土地性质和审批手续是否齐全，避免损失扩大。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细方案。