在建设用地上设施农用地是否违法，需视具体情况而定，关键在于是否满足法定条件和程序。以下是对此问题的详细分析：
合法建设设施农用地的条件与程序
符合设施农用地定义及规划要求：
- 设施农用地包括生产设施用地、附属设施用地及配套设施用地，畜禽水产养殖设施等用地属于其中一部分。若建设用地符合设施农用地的定义，并且符合当地土地利用总体规划、村庄规划及农业发展规划等相关要求，则可能合法。
办理备案手续：
- 在设施建设前，经营者需与乡镇政府和农村集体经济组织协商土地使用年限、土地用途、补充耕地、土地复垦措施等，并签订用地协议。之后，需向县级自然资源主管部门和农业部门提出备案申请，提交设施建设方案、用地协议等材料。若未办理相关备案手续，则可能构成违法。
不改变土地用途本质：
- 设施农用地必须严格按照规定的用途使用，不得擅自改变为商业、工业或其他非农业用途。若在建设用地上设施农用地的过程中改变了土地的用途，如将农用地转为建设用地进行非农业建设，则属于违法行为。
遵守环保等其他规定：
- 设施农用地的建设和运营必须符合环保要求，如配套建设有效的污染防治设施，防止对周边环境造成污染。若违反环保规定，即使土地使用合法，也可能面临法律责任。
违法情况及法律责任
未经审批擅自建设：
- 若未按照规定向相关部门备案或在不符合规划的土地上私自建设设施农用地，属于违法行为。相关部门有权责令停止建设、限期改正，甚至拆除违法建筑，并可处以罚款等行政处罚。
改变土地用途：
- 若在建设设施农用地过程中改变了土地的农用地性质，如将农用地转为建设用地进行非农业生产经营，或转作其他商业用途，将违反土地管理法规。行为人将面临法律责任，包括但不限于罚款、拆除违法建筑、恢复土地原状等。
违反环保规定：
- 即使土地使用合法，若设施农用地的建设和运营未达到环保要求，如未配套建设污染防治设施或对周边环境造成严重污染，也将受到环保部门的处罚。
建议
- 充分咨询：在建设设施农用地之前，建议充分咨询当地相关部门，了解具体的政策法规和办理流程，确保合法合规地进行建设。
- 严格遵守：应严格遵守相关法律法规和规定，包括土地利用规划、备案手续、土地用途以及环保要求等，确保设施农用地的合法性和可持续性发展。
若您在建设用地上设施农用地方面存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供详细的法律建议和指导。