结论前置：损坏公司财物后，公司是否可以扣工资以及扣工资是否合法，需分情况讨论。

1. 若员工故意损坏公司财物：

   • 法律责任：员工需承担赔偿责任。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 实际操作：公司应首先与员工协商赔偿事宜，若员工同意，可从其工资中扣除相应金额作为赔偿。但扣除比例需严格遵守上述规定，不得超额扣除。

2. 若员工非故意损坏公司财物：

   • 法律责任：员工通常不需承担赔偿责任，除非能证明员工存在重大过失或故意。在一般情况下，非故意损坏属于工作中的正常风险，应由公司承担。
   • 实际操作：公司不应从员工工资中扣除赔偿费用。若公司坚持扣除，员工有权提出异议，并可通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。

3. 公司扣工资的合法性判断：

   • 合法情形：若员工故意损坏公司财物，且公司按照法律规定和劳动合同约定，从员工工资中合理扣除赔偿费用，则此行为合法。
   • 非法情形：若公司未经员工同意，擅自扣除工资作为赔偿；或扣除比例超过法律规定；或员工非故意损坏公司财物而公司仍坚持扣除工资，则此行为非法。

法律建议：

• 对于员工而言，若因工作原因不慎损坏公司财物，应主动与公司沟通，说明情况，并协商解决方案。若公司提出不合理要求，如超额扣除工资等，员工应坚决拒绝，并可通过法律途径维护自己的权益。
• 对于公司而言，应建立健全的财物管理制度和赔偿机制，明确员工在损坏公司财物时的责任和赔偿方式。在处理此类事件时，应依法行事，尊重员工的合法权益，避免引发不必要的劳动纠纷。

可能后果：

• 若公司非法扣除员工工资，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司返还非法扣除的工资，并可能获得相应的经济补偿。
• 若员工故意损坏公司财物且拒不赔偿，公司有权通过法律途径追究员工的赔偿责任，并可能因此影响员工的职业声誉和未来发展。