结论：主要领导以管理档案需要党员为由，威胁如果不入党就辞退，这种做法是不合法的。

分析：

1. 从劳动合同法的角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。劳动合同的订立、履行、变更、解除或者终止，都应当遵循这些原则。
   • 在本案中，主要领导以入党作为继续工作的条件，这实际上是对劳动者的一种不合理要求，违反了劳动合同法中的平等自愿和协商一致原则。劳动者有权根据自己的意愿选择是否入党，而用人单位不能以此作为解除劳动合同的条件。

2. 从事业单位人事管理条例的角度（如果适用）：

   • 如果综合档案馆属于事业单位，那么根据《事业单位人事管理条例》的相关规定，事业单位工作人员的聘用、考核、培训、奖励、处分等，都应当遵循一定的程序和规定。
   • 条例中并未规定入党是事业单位工作人员必须满足的条件，也未规定如果不入党就可以辞退。因此，主要领导的做法缺乏法律依据。

3. 从党员发展原则的角度：

   • 党员的发展应当遵循自愿、个别吸收的原则，成熟一个发展一个。这是党章规定的党员发展原则。
   • 主要领导以入党作为工作条件，不仅违反了劳动合同法，也违背了党员发展的基本原则，是对党员发展工作的干扰和破坏。

建议：

• 如果你遇到了这种情况，首先应当与主要领导进行沟通，明确表达自己的意愿和立场，即是否入党是个人选择，与工作无关。
• 如果沟通无果，你可以向档案馆的上级主管部门或者人事部门反映情况，寻求帮助和支持。
• 同时，你也可以考虑咨询专业的劳动法律师，了解自己的权益和可能的维权途径。

后续行动：

• 在处理此类问题时，务必保留好相关证据，如与主要领导的沟通记录、工作合同等，以便在需要时证明自己的权益。
• 如果情况严重，你也可以考虑向劳动监察部门投诉或者提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

总之，主要领导以入党作为继续工作的条件是不合法的，你有权根据自己的意愿选择是否入党，并应当积极维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。