工厂发工资不是用公司账号发，这一情况本身并不能直接证明劳动关系，但可以作为辅助证据之一。以下从不同角度为你详细分析：

劳动关系认定的核心要素

根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》等相关规定，劳动关系的认定通常需要综合考虑多个因素，包括但不限于：

1. 用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格：即工厂和劳动者都应具备相应的法律资格，如工厂应依法注册登记，劳动者应达到法定劳动年龄等。
2. 用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动：这体现了劳动者与用人单位之间的从属关系，是劳动关系的重要特征。
3. 劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分：即劳动者的工作内容应与工厂的业务范围相关联。

工资发放方式与劳动关系

工资发放方式并不是认定劳动关系的唯一或决定性因素。虽然通常情况下，用人单位会通过其公司账户向劳动者发放工资，但这并非绝对。有些工厂可能出于各种原因（如财务安排、税务筹划等）选择通过其他账户或方式发放工资。因此，仅凭工资不是通过公司账号发放这一事实，并不能直接否定劳动关系的存在。

辅助证据的重要性

在认定劳动关系时，除了工资发放方式外，还需要考虑其他辅助证据，如：

1. 劳动合同：如果劳动者与工厂签订了书面劳动合同，那么劳动合同将是认定劳动关系的重要依据。
2. 工作证、服务证等：这些证件可以证明劳动者在工厂的工作身份。
3. 考勤记录：考勤记录可以反映劳动者在工厂的工作时间和出勤情况。
4. 其他劳动者的证言：其他劳动者的证言也可以作为认定劳动关系的辅助证据。

可能的法律后果与建议

如果工厂未通过公司账号发放工资，且劳动者与工厂之间未签订书面劳动合同，那么在发生劳动争议时，劳动者可能需要提供更多证据来证明劳动关系的存在。这可能会增加劳动者的维权难度。

建议：

• 保留相关证据：劳动者应尽可能保留与工厂相关的所有证据，包括工资条、工作证、考勤记录等。
• 及时咨询律师：如果劳动者对劳动关系的认定存在疑问或担忧，应及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
• 推动签订书面劳动合同：劳动者应积极推动与工厂签订书面劳动合同，以明确双方的权利和义务。

综上所述，工厂发工资不是用公司账号发并不能直接证明劳动关系，但可以作为辅助证据之一。在认定劳动关系时，需要综合考虑多个因素，并保留相关证据以维护自己的合法权益。如果你有任何进一步的疑问或需要法律帮助，请随时向我咨询。