关于被烟草专卖行政主管部门处罚两次以上没收违法运输的烟草专卖品是否有时限的问题，结论是：相关法律法规并未明确规定一个具体的“时限”来界定“两次以上”的具体时间跨度。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，对于违法运输烟草专卖品的行为，烟草专卖行政主管部门有权进行处罚，包括没收违法运输的烟草专卖品。
   • 当行为人被处罚两次以上时，这通常意味着行为人在不同时间点实施了多次违法行为，且每次违法行为都被烟草专卖行政主管部门查处并处罚。

2. “两次以上”的理解：

   • “两次以上”是一个数量上的描述，它指的是行为人被处罚的次数，而不是一个具体的时间跨度。
   • 法律法规并未规定这两次处罚之间必须间隔多长时间，或者在一个特定的时间段内（如一年内）被处罚两次以上才构成某种更严重的违法行为。

3. 实际执法中的考虑：

   • 在实际执法中，烟草专卖行政主管部门会根据行为人的违法情节、违法次数、违法后果等因素来综合判断并作出处罚决定。
   • 如果行为人多次违法运输烟草专卖品，且每次违法行为都被查处，那么这可能会被视为行为人具有主观恶意或屡教不改，从而可能面临更严厉的处罚。

4. 法律建议：

   • 对于行为人而言，应严格遵守烟草专卖法律法规，避免违法运输烟草专卖品。
   • 如果因违法运输烟草专卖品而被处罚，应认真反思自己的行为，及时改正，并避免再次违法。
   • 如果对处罚决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。

总结来说，被烟草专卖行政主管部门处罚两次以上没收违法运输的烟草专卖品并没有一个具体的时限要求。关键在于行为人是否实施了多次违法行为，并且每次违法行为都被查处并处罚。因此，行为人应严格遵守相关法律法规，避免违法行为的再次发生。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。