公司扣员工工资是否违法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合法扣减工资的情形：

   • 法定扣减：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 约定扣减：如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了某些情况下可以扣减工资，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣减工资是合法的。例如，员工迟到、早退或违反公司其他规章制度，公司根据内部规定扣减相应工资。

2. 违法扣减工资的情形：

   • 无合法依据扣减：如果公司没有法定或约定的理由，擅自扣减员工工资，这种行为是违法的。例如，公司以“经营困难”为由，未经员工同意或未按照法定程序，单方面决定扣减员工工资。
   • 扣减比例过高：即使公司有合法依据扣减工资，但如果扣减比例超过了法定限制（如每月扣减超过工资的20%），或者扣减后员工工资低于当地最低工资标准，这种行为也是违法的。
   • 恶意扣减：公司出于报复、歧视等恶意目的扣减员工工资，同样构成违法行为。

法律建议：

• 如果员工认为公司扣减工资的行为违法，首先应当与公司进行沟通协商，要求公司说明扣减工资的理由和依据。
• 如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 在投诉或申请仲裁前，员工应当收集好相关证据，如工资条、劳动合同、公司规章制度等，以便在维权过程中提供有力支持。

可能后果：

• 如果公司违法扣减工资，除了需要补发被扣减的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
• 在极端情况下，如果公司的违法行为严重损害了员工的权益，员工还可以考虑通过法律途径追究公司的民事责任或刑事责任（如构成拒不支付劳动报酬罪等）。

总之，公司扣员工工资是否违法，需根据具体情况进行判断。如果员工对此有疑问或认为自己的权益受到侵害，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。