地下停车位使用权限协议的期限并不必然只有20年，具体需结合协议性质、土地使用权期限及双方约定综合判断。以下是具体分析：

1. 若协议性质为租赁合同
   根据《民法典》第七百零五条，租赁期限不得超过二十年；超过二十年的，超过部分无效。因此：

   • 若协议明确约定为租赁关系（如支付租金、定期续约等），则最长有效期为20年，到期后需重新签订协议或自动终止。
     
   • 若协议中未明确性质，但实际履行方式符合租赁特征（如按月/年支付费用），可能被认定为租赁合同，同样受20年期限限制。

2. 若协议性质为物权性安排（如长期使用权转让）

   • 若停车位所在土地使用权期限剩余超过20年（例如住宅用地70年），且协议约定使用期限与土地使用权期限一致（如“随土地使用权期限届满而终止”），则协议期限可能超过20年，但需以土地使用权到期为前提。
     
   • 若协议约定使用期限超过土地使用权剩余期限（如土地剩余30年，协议约定50年），超出部分可能因违反法律强制性规定（如《民法典》第三百五十九条关于住宅建设用地使用权期限的规定）而被认定无效。

3. 特殊情形：人防工程停车位
   若停车位属于人防工程改造（平时作为停车位使用），其使用权通常需遵循《人民防空法》及地方性法规。部分地区规定人防车位使用权期限不得超过20年，但需结合具体地方政策判断。

建议：

• 签订协议前，务必核实土地使用权性质及剩余期限（可通过不动产登记中心查询）；
  
• 明确协议性质（租赁/转让/其他），避免因性质模糊导致期限争议；
  
• 若涉及长期使用，建议约定“随土地使用权期限届满自动终止”等条款，确保合法性。
  

如有具体协议文本或地方政策疑问，可进一步提供细节，我将为您详细分析。