结论前置：单位因漏收费而直接从员工工资中扣除款项，这一行为是否违法，需根据具体情况来判断，但一般情况下，未经员工同意，单位不得随意扣除员工工资。
详细分析：
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是工资支付的基本原则，旨在保障劳动者的合法权益。
单位扣工资的合法情形：
- 单位并非在任何情况下都不能扣除员工工资。在特定情形下，如劳动者因本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但这种扣除需满足一定条件：一是劳动合同中有明确约定；二是扣除的金额不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 若单位因漏收费而试图从员工工资中扣除款项，这并不直接属于上述合法扣除的情形。除非能够证明漏收费是由于员工的故意或重大过失造成的，并且劳动合同中有相关约定，否则单位无权直接扣除。
单位行为的合法性判断：
- 如果单位未经员工同意，直接从工资中扣除漏收费用的款项，这很可能构成违法扣除工资。员工有权向劳动监察部门投诉，要求单位补发被扣除的工资，并可能面临相应的法律责任。
- 另一方面，如果单位能够与员工协商一致，或者通过法律程序（如劳动仲裁）证明漏收费是由于员工的责任，并且按照法律规定和劳动合同约定进行扣除，那么这种扣除可能是合法的。
建议与措施：
- 对于员工而言，如果遇到单位未经同意扣除工资的情况，应首先与单位进行沟通协商，要求单位说明扣除的原因和依据。
- 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 对于单位而言，应建立健全的财务管理制度，避免漏收费等问题的发生。如果确实需要扣除员工工资，应确保符合法律规定和劳动合同约定，并与员工进行充分沟通。
总结与提醒：单位因漏收费而直接从员工工资中扣除款项的行为，在未经员工同意且不符合法律规定和劳动合同约定的情况下，是违法的。员工应了解自己的权益，并在必要时采取法律措施来维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。