核心结论：在打架互殴且双方均未受伤，一方逃跑且拒绝和解的情况下，90天后可能面临以下处理方式，具体需结合案件细节和当地执法实践综合判断：

1. 公安机关可能继续推进治安处罚程序

• 法律依据：根据《治安管理处罚法》第43条，殴打他人或故意伤害他人身体的，可处5-10日拘留并罚款；情节较轻的（如未造成伤害），可处5日以下拘留或500元以下罚款。
• 程序逻辑：即使一方逃跑，公安机关仍可通过调查取证（如现场监控、证人证言、双方陈述等）固定证据，认定违法事实后作出处罚决定。逃跑行为本身不构成免责理由，但可能影响处罚幅度（如从轻或从重）。
• 时间限制：治安案件的追诉期为6个月（《治安管理处罚法》第22条），90天后仍在追诉期内，公安机关仍可依法处理。

2. 若证据不足，可能终止调查或不予处罚

• 关键点：若公安机关无法收集到充分证据证明互殴事实（如无监控、证人，双方陈述矛盾），可能依据《公安机关办理行政案件程序规定》第259条终止调查，或作出不予处罚决定。
• 实践提示：逃跑方若长期隐匿，可能导致证据灭失（如现场痕迹消失、证人记忆模糊），反而增加公安机关认定事实的难度。

3. 民事赔偿请求可能因时效问题受限

• 法律背景：若一方主张民事赔偿（如误工费、精神损害等），需通过民事诉讼解决。根据《民法典》第188条，民事诉讼时效为3年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起算。
• 现实影响：90天后提起民事诉讼不受影响，但若拖延过久，可能因证据缺失（如医疗记录、收入证明）导致赔偿主张难以支持。

4. 逃跑方的法律风险

• 行政风险：若逃跑方被认定为违法方，其逃避调查的行为可能被视为“态度恶劣”，导致处罚加重（如从罚款升级为拘留）。
• 刑事风险：若后续发现伤情（如逃跑方事后出现内伤），且经鉴定构成轻伤及以上，可能触发刑事立案（《刑法》第234条故意伤害罪），此时逃跑行为可能被认定为“逃避侦查”，影响量刑。

行动建议

1. 对未逃跑方：

   • 主动配合公安机关调查，提供证据（如现场照片、视频、证人联系方式）；
   • 若希望和解，可尝试通过第三方（如居委会、派出所）联系逃跑方，但需注意和解不免除行政责任（公安机关仍可处罚，但可能从轻）；
   • 若不和解，耐心等待公安机关处理结果，必要时可申请行政复议或提起行政诉讼。

2. 对逃跑方：

   • 逃避不是解决途径，建议尽快主动联系公安机关说明情况，争取从轻处理；
   • 若认为自身无过错，可委托律师协助调查，通过法律程序维护权益；
   • 警惕“伤情滞后”风险，若事后出现不适，应及时就医并保留证据。

总结：90天后案件仍可能被公安机关依法处理，具体结果取决于证据充分性、双方态度及伤情变化。建议双方摒弃逃避心理，通过合法途径解决纠纷，避免风险升级。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体细节。