核心结论：经单位同意后就读研究生期间单位发放工资的处理方式，需根据单位与员工之间的具体约定、单位规章制度以及相关法律法规综合判断，常见情况如下：

1. 若单位与员工有明确约定
   若单位与员工在劳动合同、培训协议或相关文件中明确约定了在职读研期间的工资发放标准（如全额发放、部分发放或停发），则双方应按照约定履行。例如：

   • 约定全额发放工资：单位需按约定支付，员工需完成约定的工作任务或学习目标（如取得学位后继续服务一定年限）；
     
   • 约定部分发放或停发工资：单位可按约定调整工资，但需确保不低于当地最低工资标准（若员工仍提供部分劳动）。
     

2. 若单位无明确约定但规章制度有规定
   若单位未与员工单独约定，但规章制度中规定了在职读研的工资处理方式（如视为正常出勤、按事假处理或调整薪酬），则需判断该规章制度是否合法有效：

   • 合法有效的规章制度（如经民主程序制定、已公示或告知员工）：单位可按制度执行；
     
   • 违法或未公示的规章制度：对员工不产生约束力，单位需按正常工资标准支付。
     

3. 若单位与员工均无约定且无规章制度
   根据《劳动合同法》及相关司法实践，若员工在职读研期间仍为单位提供劳动（如兼职、远程工作或完成特定任务），单位应支付相应工资；若员工未提供劳动（如全日制脱产学习），单位可停发工资，但需注意：

   • 若单位曾承诺支付工资（如口头承诺或过往惯例），可能构成事实合同关系，单位仍需支付；
     
   • 若单位以“支持深造”为由发放工资，可能被视为福利或奖励，需按单位内部规定或双方约定处理。
     

风险提示与建议：

• 对员工：建议与单位签订书面协议，明确读研期间的工资、服务期及违约责任，避免纠纷；
  
• 对单位：若需调整工资，应通过民主程序修订规章制度并公示，或与员工签订补充协议，确保合法合规。
  

如有具体协议内容或单位制度条款，可进一步提供细节，我将为您分析具体法律风险。