结论：公司员工骑电瓶车闯红灯撞上别人电瓶车逃逸后死亡，是否能认定为工伤，关键在于事故责任认定及是否满足上下班途中的合理条件，且逃逸行为本身不影响工伤认定，但可能影响事故责任的划分。以下从不同角度进行分析：
一、上下班途中的认定
根据《工伤保险条例》第十四条的规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。这里的“上下班途中”通常指的是职工从居住地到工作地或反之的合理路线和时间内。如果事故发生在这条合理路线上，并且是在合理的上下班时间内，那么这一条件就得到了满足。
二、非本人主要责任的认定
事故责任划分：
- 骑电瓶车闯红灯是一种严重的交通违法行为，通常情况下，交警在进行事故责任认定时，会考虑这一行为对事故发生的影响。
- 如果员工因闯红灯导致事故发生，且被交警认定为承担主要责任（包括全部责任），则不符合工伤认定的条件。
- 如果员工虽然闯红灯，但事故主要由对方电瓶车造成，且交警认定员工承担的是同等责任、次要责任或无责任，那么在满足其他条件的情况下，仍有可能被认定为工伤。
逃逸行为的影响：
- 逃逸行为本身并不影响工伤的认定，但可能影响事故责任的划分。逃逸可能导致事故现场被破坏，使得交警难以准确判断事故责任。
- 如果逃逸行为导致事故责任无法认定，或者逃逸行为本身被认定为违法行为，从而加重了员工的责任，那么这可能影响工伤的认定。
三、逃逸行为的法律后果
- 逃逸行为可能构成交通肇事逃逸，根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，逃逸者可能面临行政处罚，甚至刑事责任。
- 逃逸行为还可能影响民事赔偿的承担。在交通事故中，逃逸者可能需要承担更多的赔偿责任。
四、综合分析与建议
及时报警并配合调查：
- 在发生交通事故后，员工或其家属应及时报警，并配合交警进行事故责任认定。这是认定工伤的重要前提。
收集证据：
- 收集与事故相关的证据，如现场照片、证人证言、监控录像等，以便在工伤认定过程中提供有力支持。
咨询专业律师：
- 由于工伤认定涉及复杂的法律程序和事实认定，建议员工或其家属在发生事故后及时咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。我是林春凯律师，专注于交通事故、婚姻家庭、劳动纠纷领域，如果你有相关法律问题，可以直接向我咨询。
关注逃逸行为的法律后果：
- 逃逸行为不仅可能影响工伤的认定，还可能带来其他法律后果。因此，员工应严格遵守交通规则，避免逃逸行为的发生。
总结：公司员工骑电瓶车闯红灯撞上别人电瓶车逃逸后死亡，是否能认定为工伤，取决于事故责任认定及是否满足上下班途中的合理条件。逃逸行为本身不影响工伤认定，但可能影响事故责任的划分和民事赔偿的承担。因此，在处理此类事故时，应综合考虑多个因素，并咨询专业律师以维护自身权益。