担保函并不一定是三方协议，它可以是双方协议，也可以是三方协议，具体取决于担保函的内容和签署方。以下是对这一问题的详细分析：

一、担保函的基本性质

担保函是担保人向债权人出具的，承诺在债务人不履行债务时，由担保人按照约定履行债务或者承担责任的书面文件。担保函的核心在于担保人的承诺和责任，其形式和内容可以多种多样。

二、担保函作为双方协议的情况

1. 定义与特征：当担保函仅涉及担保人和债权人两方时，它构成双方协议。这种担保函通常明确担保人对债权人的担保责任，不涉及第三方。
2. 实例说明：例如，甲公司向乙银行申请贷款，丙公司作为担保人向乙银行出具担保函，承诺在甲公司不履行还款义务时，由丙公司承担还款责任。此时，担保函仅涉及丙公司（担保人）和乙银行（债权人）两方，构成双方协议。

三、担保函作为三方协议的情况

1. 定义与特征：当担保函涉及担保人、债权人和债务人三方时，它构成三方协议。这种担保函不仅明确担保人对债权人的担保责任，还可能涉及债务人对债权人的债务关系以及三方之间的其他约定。
2. 实例说明：继续以甲公司向乙银行申请贷款为例，如果丙公司作为担保人出具的担保函中不仅承诺了还款责任，还明确规定了甲公司（债务人）的还款义务、乙银行（债权人）的放款条件以及三方之间的其他权利和义务，那么这份担保函就构成了三方协议。

四、法律建议与注意事项

1. 明确签署方：在签署担保函时，应明确签署方是双方还是三方，以及各方的权利和义务。这有助于避免后续纠纷和误解。
2. 审查担保函内容：无论是双方协议还是三方协议，都应仔细审查担保函的内容，确保担保人的承诺和责任明确无误，且符合法律法规的规定。
3. 考虑法律后果：在签署担保函前，应充分考虑担保可能带来的法律后果，包括担保人可能承担的还款责任、债务人的违约责任等。

如有任何关于担保函或债权债务方面的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。