结论：国企女员工45岁自动离职，公司是否需要赔付，不能一概而论，需根据离职的具体原因和情况来判断。以下从不同角度进行分析：
一、若自动离职是员工个人原因
员工主动辞职：
- 如果45岁的女员工是出于个人原因（如家庭、健康、职业规划等）主动提出辞职，并且按照公司规定和劳动合同法的要求，提前通知了公司并办理了离职手续，那么公司通常不需要支付经济补偿。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。在此情况下，用人单位无需支付经济补偿。
员工未提前通知或违反公司规定离职：
- 如果员工未按照公司规定或劳动合同法的要求提前通知公司，或者违反了公司的规章制度而离职，公司可能不需要支付经济补偿，甚至有权要求员工赔偿因擅自离职给公司造成的损失。
- 法律依据：同样依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者违反规定解除劳动合同，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
二、若自动离职是公司原因或双方协商一致
公司违法解除劳动合同：
- 如果公司存在违法行为（如未按时支付工资、未提供劳动保护或劳动条件、强迫劳动等），导致员工被迫离职，那么公司需要支付经济补偿，甚至可能面临赔偿金。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条和第四十八条，用人单位存在违法行为导致劳动者解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。如果用人单位违反规定解除或者终止劳动合同，劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照规定支付赔偿金。
双方协商一致解除劳动合同：
- 如果公司和员工经过协商，一致同意解除劳动合同，并且就经济补偿等事项达成了协议，那么公司需要按照协议支付经济补偿。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条和第四十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同，并应当向劳动者支付经济补偿（除非双方另有约定且不违反法律规定）。
三、特殊情况：女员工达到退休年龄
- 如果45岁的女员工已经达到法定退休年龄（目前女性工人的法定退休年龄为50周岁，但具体可能因地区和行业而异，且存在提前退休等特殊情况），并且开始依法享受基本养老保险待遇，那么她与公司之间的劳动合同将自动终止。在此情况下，公司通常不需要支付经济补偿。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条，劳动者开始依法享受基本养老保险待遇的，劳动合同终止。同时，根据该法第四十六条，此情况下用人单位无需支付经济补偿。但需注意，如果女员工虽达到退休年龄但未享受养老保险待遇，且非因本人原因停缴社保，则可能仍需支付经济补偿。
建议：
- 对于员工而言，如果因公司原因被迫离职或双方协商一致解除劳动合同，应确保与公司就经济补偿等事项达成明确协议，并保留好相关证据。
- 对于公司而言，应严格遵守劳动合同法的规定，避免违法行为导致员工被迫离职，并在解除劳动合同时与员工协商一致，明确经济补偿等事项。
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