病假缺勤扣工资的计算方法主要依据国家法律法规、地方性规定以及用人单位的规章制度，具体计算方式需结合实际情况判断。以下是不同情形下的计算规则及说明：

1. 医疗期内的病假工资计算
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期内员工享有病假工资或疾病救济费，具体标准如下：

   • 连续工龄不满2年：按本人工资的60%计发；
     
   • 连续工龄满2年不满4年：按本人工资的70%计发；
     
   • 连续工龄满4年不满6年：按本人工资的80%计发；
     
   • 连续工龄满6年不满8年：按本人工资的90%计发；
     
   • 连续工龄满8年及以上：按本人工资的100%计发。
     注意：
     
   • 本人工资指劳动合同中约定的工资，若低于当地最低工资标准，则按最低工资标准计算；
     
   • 医疗期长度根据工龄和单位工作年限确定（如3-24个月），具体可参考《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第三条。

2. 医疗期外的病假工资计算
   医疗期满后，若员工仍无法返岗工作，用人单位可依法解除劳动合同，但需支付经济补偿金。此阶段一般不再发放病假工资，但需根据地方规定处理（如部分地区要求支付疾病救济费）。

3. 地方性规定的补充规则
   部分地区对病假工资有更高要求，例如：

   • 上海：病假工资不得低于当地最低工资标准的80%；
     
   • 北京：病假工资按劳动合同约定计算，但不得低于最低工资标准的80%；
     
   • 广东：病假工资按本人工资的40%-100%计发，具体比例由单位规章制度确定。
     建议：查询当地《工资支付条例》或咨询人社部门，确认具体标准。

4. 用人单位规章制度的合法性审查
   若单位规章制度中规定的病假工资计算方式低于法定标准，则该条款无效，需按法律法规执行；若高于法定标准，则按单位规定执行。
   示例：单位规定“病假工资按本人工资的50%计发”，但员工工龄满5年（法定应发80%），则单位需按80%支付。

行动建议：

1. 核对劳动合同中关于病假工资的约定；
   
2. 查询当地最低工资标准及病假工资专项规定；
   
3. 若单位扣发工资不合理，可先与HR协商，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   

如有具体案例或地方政策疑问，可进一步说明情况，我会为您详细分析。