结论：农村自来水井房产权归您公司，他人交钱收水费是否违法，需根据具体情况判断。若您公司授权他人代收水费，则不违法；若未经授权，他人擅自收费则可能违法，具体涉及无权代理或侵权责任问题。

法律分析：

1. 产权归属与收费权限：

   • 产权归属：您公司作为农村自来水井房的产权人，依法享有对该设施的所有权，包括使用、收益和处分的权利。
   • 收费权限：基于产权，您公司有权决定如何收取水费，包括是否委托他人代收。若您公司明确授权他人代收水费，并签订了相关协议，则他人收费行为合法。

2. 未经授权擅自收费的法律后果：

   • 无权代理：若他人未经您公司授权，擅自以您公司名义收取水费，可能构成无权代理。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权代理行为未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力，由行为人承担责任。因此，您公司有权拒绝承认该收费行为，并要求行为人返还非法所得。
   • 侵权责任：若他人擅自收费行为给您公司造成了经济损失，如水费流失、声誉损害等，您公司有权要求行为人承担侵权责任，包括赔偿损失、恢复名誉等。

3. 实际操作建议：

   • 明确授权：若您公司希望委托他人代收水费，应签订书面授权协议，明确双方的权利义务，包括收费标准、收费方式、费用结算等，以避免纠纷。
   • 加强监管：您公司应加强对水费收取情况的监管，定期核对水费收入，确保水费及时、足额收取，防止他人擅自收费或挪用水费。
   • 法律维权：若发现他人擅自收费行为，您公司应及时收集证据，如收费凭证、证人证言等，并咨询专业律师，通过法律途径维护自身权益。

法律依据：

• 《中华人民共和国民法典》第一百七十一条：行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后，仍然实施代理行为，未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力。
• 《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条：行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。

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