结论前置：三十年厂房无证是否算合法或仅属于历史问题，需结合建房时的法律法规、规划要求及历史背景综合判断，不能简单一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、不算违建或可视为历史问题的情况
当时法律未强制要求办理证件：
- 在三十年前，即20世纪90年代左右，我国许多地方的房地产管理和城乡规划法规尚不完善，对厂房等建筑物的产权登记和规划审批要求不严格。
- 若在当时，建房并未被强制要求办理产权证书等手续（如仅需经当地相关部门或集体同意即可建房），则不能以现行法律规定去认定这些无证厂房为违建。
符合当时规划和政策：
- 即使当时存在相关规划和政策要求，若厂房的建造符合当地规划、政策及用地要求，仅因历史原因或行政程序不完善未能办理证件，也不应简单认定为违建。
- 例如，按当时政府统一规划和安排建设的厂房，虽未及时办理产权证件，但不应被视为违建。
历史遗留问题：
- 对于因历史遗留问题导致的无证情况，政府通常会根据实际情况制定特殊政策或处理办法。厂房所有者应及时了解并申请补办相关手续，以避免不必要的麻烦。
二、可能算违建的情况
违反当时有效的法律法规：
- 尽管当时的法律体系不如现在健全，但已存在基本的土地管理和建设相关法规。若厂房建设严重违反当时法律法规（如在禁止建设区域建房、未经审批擅自占用农田等），即使建造于三十年前，也可能被认定为违建。
- 例如，若厂房建设违反了当时已颁布实施的《中华人民共和国土地管理法》中关于土地使用和审批程序的规定，可能面临违建认定。
不符合当前公共利益和规划调整：
- 随着城市和乡村发展规划的调整，原厂房所在区域可能被规划为公共设施用地、绿地等。若厂房存在严重影响新规划实施和公共利益，即使建造时有一定合理性，也可能被认定为需要拆除的违建。
三、综合判断与建议
- 判断依据：判断厂房是否算违建，需综合考虑建房时和现在的法律法规、规划要求及各种历史因素。这包括但不限于建房时的土地管理法规、城乡规划法规、当地政府的规划和政策要求等。
- 建议行动：
- 厂房所有者应主动了解当地自然资源主管部门的相关政策和规定，特别是关于历史遗留问题无证厂房的处理办法。
- 及时咨询专业律师（即向我咨询），以获取针对具体厂房情况的具体帮助和建议。律师可以根据厂房的建造时间、地点、用途、是否符合当时和现在的规划要求等因素，进行综合分析，为厂房所有者提供法律意见。
- 对于存在历史遗留问题的无证厂房，应尽快按照政府制定的特殊政策或处理办法申请补办相关手续，以确保厂房的合法性。
综上所述，三十年厂房无证是否算合法或仅属于历史问题，需根据具体情况进行综合分析。厂房所有者应积极配合政府相关部门的工作，及时了解并遵守相关法律法规和规划要求，以确保自身权益不受损害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。