针对您提出的“完工后才知道自己夫妻公司是违规招标怎么办”这一问题，我的结论是：您需要立即采取一系列措施来应对这一违规情况，以减少可能的法律风险和经济损失。以下是从不同角度为您详细分析的建议：

1. 了解违规招标的具体情形：

   • 首先，您需要明确违规招标的具体内容，比如是招标程序违规、资格预审违规，还是存在串标、围标等不正当竞争行为。这有助于您更准确地评估问题的严重性和可能面临的法律后果。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标活动应当遵循公开、公平、公正和诚实信用的原则。任何违反这些原则的行为都可能构成违规招标。

2. 评估法律后果：

   • 违规招标可能导致合同无效或被撤销，进而影响到您公司的权益和已完成工程的结算。此外，还可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
   • 具体后果：如果合同被认定无效，您可能无法按照原合同条款获得工程款，甚至需要返还已收取的款项。同时，如果违规行为被行政机关查处，还可能面临罚款等行政处罚。

3. 采取应对措施：

   • 内部自查：立即对公司内部的招标流程、文件记录等进行全面自查，以确认违规的具体环节和责任人。
   • 与相关部门沟通：主动与招标人、监管部门等沟通，说明情况，寻求解决方案。如果可能，可以尝试通过协商、补正程序等方式纠正违规行为。
   • 法律救济：如果协商无果，且您认为公司的权益受到侵害，可以考虑通过法律途径维护自身权益。这可能包括提起行政诉讼或民事诉讼等。
   • 预防措施：加强公司内部的合规管理，完善招标流程，确保未来招标活动的合法性和合规性。

4. 考虑合同效力及工程结算：

   • 如果合同被认定无效，您需要根据《中华人民共和国民法典》中关于合同无效的规定，与招标人协商工程款的结算问题。通常，已经完成的工程部分，如果质量合格，招标人应当支付相应的工程款。
   • 计算公式（若涉及具体金额计算）：工程款结算金额 = 已完成工程量 × 单价（或合同约定的结算方式）。但需注意，由于合同无效，单价或结算方式可能需要重新协商或依据法律规定确定。

5. 寻求专业法律帮助：

   • 鉴于违规招标问题的复杂性和法律后果的严重性，我建议您尽快咨询专业律师，以便更全面地了解您的法律权益和可能的法律风险，并制定有效的应对策略。

最后，我想强调的是，面对违规招标问题，您需要保持冷静，积极采取措施应对，以减少可能的损失。同时，加强公司内部的合规管理，确保未来招标活动的合法性和合规性，也是非常重要的。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。