小区二次加压泵房建在地上是否合法，需结合具体情况判断，主要考虑规划许可、安全距离、环保要求及业主权益等因素。以下从不同角度详细分析：
1. 规划许可角度
- 合法性前提：二次加压泵房作为小区配套设施，其建设需符合城市规划要求，并取得《建设工程规划许可证》。若泵房建设前已依法办理规划手续，且位置、规模等符合规划要求，则地上建设合法。
- 违规后果：若未取得规划许可或擅自变更规划（如将地下泵房改为地上），可能面临规划部门处罚（如限期拆除、罚款），且可能影响房屋产权登记或交易。
2. 安全距离与环保要求
- 安全距离：根据《建筑设计防火规范》等规定，泵房需与住宅保持一定安全距离（如避免噪音、振动影响）。若泵房紧邻住宅且未采取有效隔音措施，可能构成违规。
- 环保要求：泵房运行可能产生噪音、振动等，需符合《社会生活环境噪声排放标准》等环保要求。若未通过环保验收或超标排放，可能被责令整改或处罚。
3. 业主权益保护
- 知情权与同意权：根据《民法典》第278条，改变共有部分的用途或利用共有部分从事经营活动，需经业主共同决定（双三分之二参与表决，双四分之三同意）。若泵房建设涉及共有部分（如小区公共绿地），需经业主大会同意，否则可能侵害业主权益。
- 补偿机制：若泵房建设对部分业主造成实际影响（如噪音、采光），业主可要求开发商或物业采取补救措施（如安装隔音设施）或协商补偿。
4. 特殊情形处理
- 历史遗留问题：若泵房建于《民法典》实施前（2021年1月1日前），且符合当时规划要求，可能适用“法不溯及既往”原则，但若存在安全隐患或环保问题，仍需整改。
- 紧急情况：如因供水压力不足需紧急建设泵房，可先向规划部门申请临时许可，后续补办手续，但需尽快完善合法程序。
建议行动
- 核查规划手续：向物业或开发商索要泵房的《建设工程规划许可证》及竣工验收文件，确认其合法性。
- 评估实际影响：若泵房产生噪音、振动等，可委托专业机构检测，若超标可向环保部门投诉或通过法律途径要求整改。
- 协商或诉讼：若泵房建设侵害业主权益，可先与开发商、物业协商解决；协商不成，可向法院起诉要求停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。
如有具体纠纷或需要进一步分析，可直接向我咨询，我会结合您所在地区的具体规定和案例提供针对性建议。