结论：合同中约定加盖公章，但实际加盖的是合同专用章，合同仍然可以生效，但具体是否生效还需结合其他因素综合判断。

分析说明：

1. 公章与合同专用章的法律效力：

   • 公章是单位对外行使权力的标志，具有最高的法律效力，通常用于重要文件、合同等。
   • 合同专用章是单位专门用于签订合同的印章，其法律效力在合同签订领域内与公章相当。根据《民法典》及相关司法实践，只要合同专用章是真实、合法且由单位授权使用的，它就能代表单位在合同上的意思表示，因此合同专用章在合同签订上具有与公章同等的法律效力。

2. 合同生效的条件：

   • 合同生效通常需要满足几个基本条件：当事人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定、不违背公序良俗。
   • 在印章使用上，虽然合同约定加盖公章，但实际加盖的是合同专用章，这并不直接导致合同无效。关键在于合同专用章是否真实反映了单位的意思表示，以及合同内容是否合法有效。

3. 实际案例与司法实践：

   • 在司法实践中，法院通常会根据合同的实际履行情况、双方当事人的交易习惯、合同专用章的使用情况等因素来综合判断合同的效力。
   • 如果合同专用章是单位合法使用，且合同内容合法有效，那么即使合同中约定加盖公章，实际加盖的是合同专用章，合同仍然可以生效。

特殊场景：

• 如果合同中有特别约定，如“必须加盖公章方为有效”，那么在这种情况下，实际加盖合同专用章可能会导致合同效力存在争议。但即便如此，也不能直接认定合同无效，而是需要结合其他证据和事实来综合判断。
• 如果合同专用章是伪造或盗用的，那么合同显然不能生效，因为这并不代表单位的意思表示。

行动建议：

• 对于合同签订方：在签订合同时，应仔细核对合同中的印章使用约定，并确保实际使用的印章与约定一致。如果确实需要使用合同专用章代替公章，最好在合同中明确说明或取得对方的书面同意。
• 对于合同审查方：在审查合同时，除了关注合同内容外，还应仔细核对合同中的印章使用情况，确保印章的真实性和合法性。如果发现印章使用与约定不符，应及时与对方沟通并确认合同的效力。

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