结论：不合格钢化玻璃三年后发现不合格，是否可以进行行政处罚，需根据具体情况判断，主要涉及行政处罚的时效性、违法行为的持续性以及相关证据的收集等因素。以下从不同角度进行分析：
行政处罚的时效性：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条：“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。”
- 若不合格钢化玻璃的生产或销售行为在三年前发生，且不属于涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的情形，那么从时效性角度看，可能已超过行政处罚的二年期限（或五年期限，如适用），此时行政机关可能无法再对此行为进行行政处罚。
违法行为的持续性：
- 如果不合格钢化玻璃的生产或销售行为是一个持续的过程，例如生产商一直生产不合格产品，或者销售商一直销售该不合格产品，且该行为在三年内未停止，那么行政机关仍有可能对该持续违法行为进行行政处罚。
- 在这种情况下，关键在于证明违法行为的持续性，以及该行为在行政处罚时效期限内仍在进行。
相关证据的收集：
- 无论是否超过行政处罚的时效期限，行政机关都需要有充分的证据来证明不合格钢化玻璃的生产或销售行为确实存在，以及该行为是否违反了相关法律法规。
- 证据可能包括产品质量检测报告、销售记录、生产记录、证人证言等。如果证据不足或无法证明违法行为的存在，行政机关将无法进行行政处罚。
法律建议：
- 如果您是消费者或相关利益方，发现不合格钢化玻璃的生产或销售行为，且该行为仍在持续或未超过行政处罚的时效期限，建议您及时向当地市场监督管理部门或相关行政机关举报，并提供相关证据。
- 如果您是生产商或销售商，且面临行政处罚的风险，建议您积极配合行政机关的调查，提供必要的证据和资料，以证明自己的清白或减轻处罚。同时，您也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和义务。
可能的法律后果：
- 如果行政机关认定不合格钢化玻璃的生产或销售行为确实存在，且未超过行政处罚的时效期限，那么生产商或销售商可能面临罚款、没收违法所得、责令停产停业等行政处罚。
- 如果该行为构成犯罪，如生产、销售伪劣产品罪等，那么相关责任人还可能面临刑事处罚。
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