结论概述：针对您提出的“房产证未满两年，但购房合同满了，怎么办”的问题，这主要涉及到房产交易中的税费及政策限制问题。具体如何处理，需结合当地的具体政策以及您的实际需求来决定。以下是从不同角度给出的详细分析。
一、税费角度
增值税及附加：
- 在多数地区，房产证未满两年进行转让，可能需要缴纳增值税及附加。增值税的税率通常为5%（或5.6%，包含城市维护建设税、教育费附加等），具体以当地政策为准。
- 如果房产证已满两年，则通常可以免征增值税及附加。因此，从税费角度考虑，等待房产证满两年后再进行交易可能更为划算。
个人所得税：
- 个人所得税的缴纳与房产证持有时间、是否唯一住房等因素有关。如果房产证未满两年且非唯一住房，转让时可能需要缴纳较高的个人所得税。
- 同样，等待房产证满两年后，如果符合当地政策规定的免税条件（如唯一住房等），则可能免征个人所得税。
二、政策限制角度
限售政策：
- 部分地区为了抑制房价过快上涨，实施了限售政策，即房产证未满一定年限（如两年、三年等）不得转让。
- 如果您所在地区有此类政策，那么即使购房合同满了，也可能无法立即进行房产转让，需要等待房产证满年限后才能操作。
购房资格与贷款政策：
- 如果您是打算再次购房，那么还需要考虑当地的购房资格政策以及贷款政策。有些地区对购房者的房产证持有时间有要求，或者对贷款额度、利率等有所限制。
- 因此，在决定是否等待房产证满两年时，也需要综合考虑这些因素。
三、实际操作建议
咨询当地房产部门或税务部门：
- 由于不同地区的政策存在差异，建议您首先咨询当地房产部门或税务部门，了解具体的税费政策及限售政策。
评估自身需求与风险：
- 根据您的实际需求（如是否急需资金、是否打算再次购房等）以及风险承受能力（如税费成本、政策变化风险等），来决定是否等待房产证满两年后再进行交易。
考虑其他交易方式：
- 如果等待房产证满两年对您来说成本过高或风险过大，您也可以考虑其他交易方式，如通过租赁、抵押等方式实现资金回笼或资产保值增值。但需要注意的是，这些方式也可能涉及一定的法律风险和税费成本，需要谨慎操作。
四、特殊情况说明
- 如果您是因为特殊原因（如离婚、继承等）需要立即进行房产转让，且符合当地政策规定的免税或减税条件，那么可以向相关部门申请免税或减税处理。但具体流程和所需材料可能因地区而异，需要您提前了解并准备。
总结与建议：针对您提出的问题，建议首先咨询当地房产部门或税务部门了解具体政策；其次评估自身需求与风险；最后根据实际情况选择合适的交易方式或等待时机。如果您在操作过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。