部门扣款是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 合法扣款的情况：

   • 依据合法规章制度：如果公司有明确的规章制度，且这些规章制度经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），并向员工进行了公示或告知，同时扣款的内容不违反国家法律、行政法规及政策规定，那么公司依据这些规章制度对员工进行扣款是合法的。例如，员工因违反公司操作规程导致设备损坏，公司根据规章制度要求员工承担部分维修费用，这种扣款就是合法的。
   • 法定扣款情形：根据相关法律法规，如《工资支付暂行规定》等，在某些特定情况下，公司可以从员工工资中扣除一定费用。比如，员工因个人原因给公司造成经济损失，公司可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，并从其工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 违法扣款的情况：

   • 无合法依据扣款：如果公司没有明确的规章制度，或者规章制度未经民主程序制定、未向员工公示或告知，或者扣款的内容违反了国家法律、行政法规及政策规定，那么公司对员工进行扣款就是违法的。例如，公司随意以“表现不佳”为由扣减员工工资，且没有相应的规章制度支持，这种扣款就是违法的。
   • 扣款超出法定限度：即使公司有合法的扣款依据，但如果扣款金额超出了法定限度，也是违法的。如前所述，员工因个人原因给公司造成经济损失时，公司每月从其工资中扣除的部分不得超过当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。如果公司扣款超出这个限度，就是违法的。
   • 强制扣款用于非法定目的：公司不得强制将员工的工资扣款用于非法定目的，如强制员工购买公司产品、捐赠给慈善机构等。这种扣款不仅违法，还侵犯了员工的合法权益。

法律建议：

• 如果您认为公司对您的扣款是违法的，您可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣款的依据和理由，并出示相关的规章制度。
• 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报，要求劳动监察部门介入调查并处理。
• 您也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司违法扣款被查实，劳动监察部门会责令公司限期支付扣款，并可能对公司处以罚款等行政处罚。
• 如果您通过劳动仲裁或诉讼途径维护自己的权益，且仲裁或诉讼结果支持您的主张，公司不仅需要支付扣款，还可能需要支付额外的经济补偿或赔偿金。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。