针对您提出的“公司员工骗取贷款怎么处理”这一问题，这确实是一个涉及刑事、民事以及公司内部管理多个层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、刑事处理方面
立即报警：
- 一旦发现员工有骗取贷款的行为，公司应立即向公安机关报案。这是维护公司权益、防止损失扩大的首要步骤。公安机关将依据《中华人民共和国刑事诉讼法》进行立案侦查，收集犯罪证据，并查明犯罪事实及犯罪嫌疑人。
罪名认定与量刑：
- 员工骗取贷款的行为可能构成贷款诈骗罪。根据《中华人民共和国刑法》第一百九十三条，若员工以非法占有为目的，诈骗银行或其他金融机构的贷款，且数额较大，将面临五年以下有期徒刑或拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处罚将更重。
- 如果员工的行为还涉及与金融机构签订合同，并符合合同诈骗罪的构成要件，那么依据《刑法》第二百二十四条，员工也将面临相应的刑事处罚。
配合调查：
- 公司应积极配合公安机关的调查工作，提供必要的信息和证据，如员工身份信息、贷款合同、交易记录等，以协助公安机关快速查清事实。
二、民事处理方面
公司对金融机构的责任：
- 如果金融机构有理由相信员工的行为代表公司（如员工使用了公司公章或具有公司授权的表象），公司可能需对贷款承担偿还责任。但公司事后有权向实施诈骗的员工追偿。
- 如果金融机构无法证明员工行为代表公司，且公司能提供充分证据证明该行为系员工个人诈骗，则公司无需承担民事责任。
公司向员工索赔：
- 公司因员工骗取贷款导致的所有直接和间接损失，包括但不限于贷款本金、利息、律师费、诉讼费等，均有权通过民事诉讼向员工追偿。
受害者权益保护：
- 受害者（如金融机构）有权向法院提起民事诉讼，要求犯罪者（即员工）承担民事赔偿责任。受害者应寻求专业律师的帮助，以确保其合法权益得到充分保障。
三、公司内部管理
紧急措施：
- 公司应立即成立专门调查小组，深入调查事件始末，查明公章管理漏洞、员工诈骗手段及资金流向等关键信息。
制度完善：
- 加强公章管理，建立严格的公章使用审批制度，确保公章使用有记录、可追溯。
- 强化员工法律教育和培训，提高员工的法律意识和风险防范能力。
- 完善贷款审批流程、风险防范机制及员工监督机制，防止类似事件再次发生。
- 建立健全员工背景调查和定期培训机制，确保员工素质符合公司要求。
反思与整改：
- 公司应深刻反思自身在管理上是否存在疏漏或不足，及时整改和改进，以降低未来风险。
综上所述，处理公司员工骗取贷款的问题需要从刑事、民事及公司内部管理三个方面综合施策。公司应迅速响应、积极配合调查、加强内部管理，并依法追究员工责任，同时确保受害者的合法权益得到充分保障。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。