结论：甲方处罚施工单位吸烟是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括处罚依据、处罚方式、处罚程序等是否合法合规。以下从不同角度进行分析：
一、从处罚依据的角度分析
合同约定：
- 如果甲方与施工单位在合同中明确约定了施工现场禁止吸烟，并规定了相应的违约责任或处罚措施，那么甲方依据合同条款对施工单位进行处罚，通常是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方应当按照约定履行自己的义务，一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
法律法规：
- 如果甲方处罚施工单位吸烟是基于相关法律法规的规定，如安全生产法规、消防法规等，且处罚措施符合法律法规的要求，那么也是合法的。
- 示例：某些地区的安全生产法规可能规定，在易燃易爆场所禁止吸烟，违反者将受到罚款等处罚。如果施工现场属于此类场所，甲方依据法规进行处罚，则是合法的。
无明确依据：
- 如果甲方处罚施工单位吸烟没有合同依据，也没有法律法规的支持，那么这种处罚可能是违法的，施工单位有权拒绝接受处罚，并可以寻求法律途径维护自己的权益。
二、从处罚方式的角度分析
合理处罚：
- 如果甲方采取的处罚方式合理，如口头警告、书面警告、罚款等，且罚款数额在合理范围内，没有超出法律法规或合同约定的限度，那么这种处罚通常是合法的。
过度处罚：
- 如果甲方采取的处罚方式过于严厉，如停工整顿、解除合同等，或者罚款数额过高，超出了合理范围，那么这种处罚可能是违法的。施工单位可以对此提出异议，并寻求法律途径解决。
三、从处罚程序的角度分析
程序合法：
- 如果甲方在处罚施工单位吸烟时，遵循了合法的程序，如先进行警告、给予施工单位陈述和申辩的机会等，那么这种处罚通常是合法的。
程序违法：
- 如果甲方在处罚过程中没有遵循合法程序，如未经警告直接罚款、没有给予施工单位陈述和申辩的机会等，那么这种处罚可能是违法的。施工单位可以对此提出程序违法的主张，并寻求法律救济。
四、建议与提醒
- 对于甲方：在处罚施工单位吸烟时，应确保有明确的合同依据或法律法规支持，采取合理的处罚方式，并遵循合法的程序。
- 对于施工单位：如果认为甲方的处罚违法或不合理，可以拒绝接受处罚，并收集相关证据（如合同、法律法规、处罚通知等）寻求法律途径维护自己的权益。
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