当遇到被告公司不在注册地的情况，可以按照以下思路处理：

1. 核实注册信息与实际经营地
   首先需确认被告公司的注册地址是否真实有效。可通过国家企业信用信息公示系统、工商档案查询等官方渠道核实其登记信息。若注册地址与实际经营地不一致，需进一步调查其实际经营场所（如办公地址、生产场地等），这可能涉及通过实地走访、合同履行地、员工社保缴纳地等线索综合判断。

2. 法律文书送达的解决方案
   根据《民事诉讼法》及相关司法解释，若直接送达注册地无人签收，可采取以下方式：

   • 公告送达：在法院公告栏或省级以上报纸刊登送达公告，自公告之日起满30日即视为送达（需注意公告期可能延长诉讼周期）。
     
   • 留置送达：若能证明注册地仍为被告控制场所（如门卫签收、张贴于明显位置并拍照留证），可适用留置送达。
     
   • 电子送达：若被告曾使用电子邮箱、传真等联系方式，可申请法院通过电子方式送达（需被告事先同意）。
     

3. 管辖权异议的应对
   若被告提出管辖权异议（主张案件应由实际经营地法院管辖），需结合具体案由分析：

   • 合同纠纷：通常以合同履行地或被告住所地为管辖法院，若实际经营地与合同履行地重合，可能支持被告主张。
     
   • 侵权纠纷：一般由侵权行为地或被告住所地法院管辖，此时需重点证明侵权行为发生地与注册地的关联性。
     
   • 公司诉讼：如股东纠纷等，原则上以公司住所地（注册地）法院管辖，但若能证明主要办事机构所在地已变更，可能适用新地址。
     

4. 执行阶段的特殊处理
   若判决生效后需强制执行，而被告注册地无财产可供执行，可：

   • 向法院申请调查令，查询被告实际经营地的财产线索（如银行账户、房产、车辆等）。
     
   • 申请将被告列入失信被执行人名单，限制其高消费及非生活必需消费行为。
     
   • 若发现被告隐匿财产或转移资产，可提起债权人撤销权之诉或追究相关人员责任。
     

温馨提示：实践中，被告公司“人去楼空”可能涉及恶意逃避债务，建议同步收集其转移资产、抽逃出资等证据，为后续追责做准备。若需进一步分析具体案情，可随时向我咨询。