若发现犯罪的公司不在其注册地，可采取以下措施：

1. 确定实际经营地并报案：

   • 首先，应尽可能通过多种渠道（如公司官网、行业信息、交易记录等）核实并确定该公司的实际经营地或主要业务活动地。
   • 确定实际经营地后，立即向该地的公安机关报案，提供所掌握的所有证据和信息，包括但不限于公司名称、涉嫌犯罪的具体行为、时间、地点、涉及人员等。
   • 公安机关会根据案件性质和管辖范围进行立案调查，若案件涉及多个地区，可能会由上级公安机关指定管辖或进行联合侦查。

2. 利用法律程序追究责任：

   • 在报案的同时，可以考虑通过民事诉讼途径追究公司的法律责任。如果因该公司的犯罪行为遭受了经济损失，可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求赔偿。
   • 民事诉讼的管辖地通常包括被告住所地（若能确定实际经营地且该地被视为经常居住地）、合同履行地（如存在相关合同）或侵权行为地（如犯罪行为发生地）。
   • 在诉讼过程中，需准备充分的证据来支持自己的主张，包括交易记录、沟通记录、损失计算依据等。

3. 关注跨区域协作与信息共享：

   • 鉴于公司可能跨区域经营，不同地区的执法机关之间可能存在协作与信息共享机制。在报案或诉讼过程中，可以主动了解并利用这些机制，促进案件的快速处理。
   • 如果发现该公司在多个地区均有违法犯罪行为，可以向国家相关监管部门（如市场监管总局、公安部经济犯罪侦查局等）举报，请求其协调各地执法机关进行联合查处。

核心前提与注意事项：

• 在整个过程中，务必保持冷静，依法行事，避免采取过激行为。
• 收集并保存所有与案件相关的证据，这是后续报案、诉讼或举报的关键。
• 若对法律程序不熟悉，建议寻求专业法律人士的帮助，以确保自身权益得到有效维护。

如有进一步的法律疑问或需要具体的法律指导，请随时向我咨询。