不同法律关系、不同事实基础的纠纷一般不应合并起诉，这主要基于诉讼程序效率和法律关系清晰性的考量，其法律依据主要体现在民事诉讼法及相关司法解释中。以下从几个方面进行详细分析：

1. 诉讼程序效率与法律关系清晰性：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，每个案件应当围绕一个明确的法律关系和事实基础进行审理。这是为了确保诉讼程序的效率，避免因为合并审理多个不同法律关系和事实基础的纠纷而导致诉讼过程复杂化、审理时间延长。
   • 实践意义：如果允许将不同法律关系、不同事实基础的纠纷合并起诉，可能会导致法庭在审理过程中需要同时处理多个相互独立或关联不大的法律问题，这不仅增加了法庭的工作负担，也可能影响案件的公正、高效审理。

2. 合并起诉的例外情况：

   • 法律依据：虽然一般情况下不同法律关系、不同事实基础的纠纷不应合并起诉，但《民事诉讼法》也规定了一些例外情况。例如，如果多个纠纷之间存在法律上的牵连关系，或者合并审理有利于节约司法资源、提高诉讼效率，法院可能会考虑合并审理。
   • 实践应用：在实际操作中，这种例外情况通常适用于那些法律关系紧密、事实基础相似或存在相互依赖关系的纠纷。例如，在建设工程领域，如果多个合同纠纷涉及同一工程项目、同一当事人或同一法律事实，法院可能会考虑合并审理以简化程序、提高效率。

3. 具体案例与司法实践：

   • 案例分析：在司法实践中，法院对于是否合并审理不同法律关系、不同事实基础的纠纷通常持谨慎态度。法院会综合考虑案件的具体情况、当事人的诉求以及诉讼效率等因素来做出决定。
   • 司法建议：对于当事人而言，如果面临多个纠纷且希望合并起诉，应当仔细分析纠纷之间的法律关系和事实基础，评估合并起诉的可行性和必要性。同时，也可以咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。

4. 法律后果与风险提示：

   • 法律后果：如果当事人错误地将不同法律关系、不同事实基础的纠纷合并起诉，可能会导致法院驳回起诉或要求当事人分开起诉。这不仅会浪费当事人的时间和精力，还可能增加诉讼成本。
   • 风险提示：因此，当事人在起诉前应当充分了解相关法律规定和司法实践，谨慎评估合并起诉的可行性和风险。如果确实需要合并起诉，应当准备充分的证据和理由来支持自己的诉求。

总结来说，不同法律关系、不同事实基础的纠纷一般不应合并起诉，这是为了维护诉讼程序的效率和法律关系的清晰性。然而，在特定情况下，如果纠纷之间存在法律上的牵连关系或合并审理有利于节约司法资源、提高诉讼效率，法院可能会考虑合并审理。当事人在面临此类问题时，应当仔细分析具体情况并咨询专业律师的意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。