结论：乡镇企业在90年代是否签订劳动合同，不能一概而论，需结合当时的具体法律法规、企业实际情况以及地方政策来综合判断。以下从多个角度进行详细分析：
法律法规层面：
- 在90年代，我国已经逐步建立了劳动法律体系，虽然不如现在完善，但已经对劳动合同的签订有了一定的规定。例如，1995年1月1日起施行的《中华人民共和国劳动法》就明确规定了用人单位与劳动者应当订立劳动合同。然而，在《劳动法》实施之前，劳动合同的签订可能并不普遍，且相关法律法规对乡镇企业的具体规定可能较为模糊或缺乏。
- 因此，如果乡镇企业在90年代后期运营，且受到《劳动法》等法律法规的约束，那么它们应当与劳动者签订劳动合同。但在90年代前期，由于法律法规的不完善，劳动合同的签订情况可能因地区和企业而异。
企业实际情况层面：
- 乡镇企业作为当时农村经济的重要组成部分，其管理水平和法律意识可能参差不齐。一些规模较大、管理较规范的乡镇企业可能更注重劳动合同的签订，以保障企业和劳动者的权益。
- 而一些规模较小、管理较松散的乡镇企业则可能忽视劳动合同的签订，或者仅以口头协议的形式约定劳动关系。这种情况下，劳动合同的签订情况就难以得到保障。
地方政策层面：
- 不同地区对乡镇企业的管理政策可能存在差异。一些地方政府可能积极推动乡镇企业签订劳动合同，以规范劳动关系、保障劳动者权益。
- 而另一些地方政府则可能由于各种原因（如经济落后、管理力量不足等）对乡镇企业的劳动合同签订情况监管不力，导致劳动合同的签订率较低。
法律建议：
- 对于劳动者而言，如果怀疑自己在90年代与乡镇企业存在劳动关系但未签订劳动合同，可以尝试收集相关证据（如工资单、工作证、同事证言等）来证明劳动关系的存在。
- 如果劳动者希望确认自己的权益是否受到侵害，或者需要寻求法律救济，可以向当地劳动争议仲裁委员会或人民法院提起仲裁或诉讼。
- 对于乡镇企业而言，如果尚未与劳动者签订劳动合同，建议尽快补签以规范劳动关系、避免法律风险。同时，乡镇企业也应加强法律意识和管理水平，确保劳动关系的合法性和稳定性。
可能后果：
- 如果乡镇企业未与劳动者签订劳动合同且无法证明劳动关系的存在，劳动者可能面临维权困难的情况。
- 如果乡镇企业因未签订劳动合同而违反相关法律法规，可能面临劳动行政部门的处罚或劳动者的法律诉讼。
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