结论：房产证上登记为四间房而实际只有三间房的情况，其合法性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从几个角度进行分析：

1. 房产证登记与实际状况不符的可能原因：

   • 登记错误：在房产证的办理或登记过程中，可能由于人为疏忽或信息传递错误，导致房产证上的房间数量与实际不符。这种情况下，房产证上的信息并不反映真实的房屋状况，需要通过法定程序进行更正。
   • 历史遗留问题：在某些情况下，房屋可能经历了多次改造或扩建，而房产证的登记信息未能及时更新。这可能导致房产证上的房间数量与实际存在差异。
   • 故意隐瞒或欺诈：虽然不常见，但也不能排除有人故意在房产证上登记错误的信息，以获取不正当利益。

2. 合法性判断：

   • 若为登记错误：根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，房产证是房屋所有权的法定证明文件，其登记信息应当准确无误。如果发现房产证上的信息与实际不符，房屋所有权人应及时向房地产管理部门申请更正登记，以确保房产证的合法性和有效性。在此情况下，房产证上四间房实际三间房的情况是不合法的，需要通过更正登记来纠正。
   • 若为历史遗留问题：如果房屋的历史改造或扩建符合当时的法律法规和规划要求，但房产证未能及时更新，那么这种情况可能涉及复杂的法律程序和历史背景。在这种情况下，房屋所有权人可能需要提供相关证据和资料，向房地产管理部门申请变更登记或确认房屋的实际状况。
   • 若为故意隐瞒或欺诈：如果房产证上的信息与实际不符是由于故意隐瞒或欺诈行为导致的，那么这种行为不仅违反了法律法规，还可能构成犯罪。在此情况下，房屋所有权人或其他相关方应立即向公安机关报案，并寻求法律援助以维护自己的合法权益。

3. 建议措施：

   • 核实房产证信息：首先，房屋所有权人应仔细核对房产证上的信息与实际房屋状况是否一致。如果发现不符，应立即采取措施进行更正。
   • 咨询专业律师：由于房产证登记与实际状况不符可能涉及复杂的法律问题和程序，建议房屋所有权人咨询专业律师以获取具体的法律建议和指导。
   • 申请更正登记：如果确认房产证上的信息存在错误，房屋所有权人应及时向房地产管理部门申请更正登记，并提供相关证据和资料以支持其申请。

总结：房产证上四间房实际三间房的情况是否合法，取决于具体的原因和背景。在发现这种情况时，房屋所有权人应首先核实房产证信息，并咨询专业律师以获取具体的法律建议和指导。如果确认存在错误或违法行为，应及时采取措施进行更正或寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。