法院可能判决保险公司承担不利法律后果，具体需结合案件细节判断程序违法是否影响当事人权利及保险公司是否尽到说明义务。以下从不同角度展开分析：
一、程序违法对拒赔通知效力的影响
根据《保险法》第二十三条，保险公司收到赔偿请求后，对不属于保险责任的，应当自作出核定之日起三日内向被保险人或受益人发出拒绝赔偿通知书，并说明理由。若保险公司未在法定期限内发出拒赔通知，可能面临以下法律后果：
程序违法导致拒赔通知无效
若保险公司超过法定期限（如100多天）才发出拒赔通知，且未提供合理延期理由（如需补充调查、等待第三方鉴定结果等），法院可能认定其未依法履行告知义务，导致拒赔通知丧失法律效力。此时，保险公司可能被要求承担赔偿责任，即使事故本身不属于保险范围。
程序违法但未影响当事人权利的例外
若保险公司虽逾期发出拒赔通知，但当事人已通过其他方式（如口头沟通、邮件等）知晓拒赔理由，或逾期未对当事人权利产生实质影响（如当事人未因逾期而错过其他救济途径），法院可能酌情减轻保险公司责任，但仍可能因程序违法对其处以警告或罚款。
二、保险公司需承担的举证责任
保险公司主张拒赔的，需对“事故不属于保险责任”承担举证责任。若其因程序违法导致关键证据灭失或无法提供（如未及时调查取证），法院可能直接推定其拒赔理由不成立，要求其承担赔偿责任。
三、当事人可主张的权益
要求保险公司赔偿损失
若法院认定保险公司程序违法且拒赔理由不成立，当事人有权要求保险公司按合同约定支付保险金。
主张逾期利息或违约金
若保险合同约定了逾期付款的违约责任，当事人可同时要求保险公司支付逾期利息或违约金。
投诉或举报保险公司违法行为
当事人可向当地银保监会投诉保险公司程序违法行为，监管部门可能对其处以行政处罚（如罚款、责令整改等）。
四、实务建议
对当事人：保留与保险公司的沟通记录（如邮件、短信、录音等），证明其未在法定期限内收到拒赔通知；若已收到通知，需核对通知内容是否完整、理由是否充分。
对保险公司：完善内部理赔流程，确保在法定期限内完成核定并发出通知；若需延期，应提前与当事人沟通并留存书面证据。
提示：具体案件需结合保险合同条款、事故性质、双方举证情况等综合判断。若有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合您的案件细节提供针对性分析。