项目部管理人员殴打员工属于违法行为，应依法追究相关责任，并可通过多种途径维护员工权益。具体处理方式如下：

1. 立即报警并保护现场
   殴打行为涉嫌违反《治安管理处罚法》第43条（故意伤害他人身体），若造成轻伤以上后果则可能构成《刑法》第234条故意伤害罪。员工应第一时间报警，由公安机关立案调查，固定伤情证据（如照片、监控录像、证人证言等）。若伤情严重，需及时就医并保留医疗记录作为后续维权依据。

2. 企业内部处理与责任追究
   根据《劳动合同法》第38条，员工有权以“用人单位未提供劳动安全卫生条件”或“强迫劳动”为由解除劳动合同，并要求经济补偿。企业应启动内部调查程序，对涉事管理人员停职处理，若查实违法行为需解除劳动合同；若构成犯罪，企业还需配合司法机关追究其刑事责任。同时，企业可能因管理失职面临行政处罚（如《安全生产法》第106条）。

3. 民事赔偿与工伤认定
   员工可依据《民法典》第1179条主张医疗费、误工费、护理费等民事赔偿。若殴打行为与工作相关（如因工作纠纷引发），可申请工伤认定（《工伤保险条例》第14条），享受工伤保险待遇。需注意：工伤认定需以“工作原因”为核心，若因私人恩怨打架则不适用。

4. 行政投诉与劳动仲裁
   若企业未依法处理，员工可向劳动监察部门投诉（如未支付工资、未提供劳动保护等），或申请劳动仲裁要求企业承担连带责任（如未及时制止违法行为导致损害扩大）。仲裁时效为1年，自知道权益受损之日起计算。

建议行动步骤：

1. 优先报警并就医，确保人身安全与证据固定；
   
2. 向企业人力资源部门或工会书面投诉，要求启动调查；
   
3. 同步准备劳动仲裁材料（劳动合同、工资记录、伤情证明等）；
   
4. 若涉及刑事犯罪，可委托律师向公安机关提交《刑事控告书》。
   

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