针对您提出的“员工举报店偷税怎么处理”这一问题，我将从企业和举报人两个角度为您详细解答。
若您是企业方：
冷静核实与立即自查：
- 企业应迅速组织财务、税务等相关专业人员，对税务申报和缴纳情况进行全面自查，确认是否存在偷税行为。
- 同时，尝试以平和的方式与举报员工取得联系，了解其举报的具体缘由、依据及掌握的证据，但不得涉及对违法行为的诱导、威胁或阻碍调查。
积极配合调查：
- 一旦税务机关介入，企业应积极主动配合，及时、完整地提供所需资料和信息，如实说明企业的经营和纳税情况。
- 若偷税行为涉嫌犯罪，公安机关、人民检察院或人民法院也可能介入，企业应同样积极配合这些机关的调查或审理工作。
依法补缴与接受处罚：
- 若确认存在偷税行为，企业应尽快按照税务机关的要求，足额补缴所偷逃的税款及滞纳金。
- 根据相关法律法规，企业可能面临罚款，甚至刑事责任，应做好相应准备。
加强内部管理：
- 企业应以此次事件为契机，全面审视和完善税务管理制度和流程，加强内部财务和税务人员的培训。
- 建立健全税务风险预警机制，及时发现和纠正潜在的税务问题。
维护自身权益：
- 若举报内容不属实，企业有权向劳动争议仲裁委员会提出申诉或直接向法院提起诉讼。
- 若举报人故意捏造事实、诬告陷害，企业可向公安机关报案。
寻求专业法律帮助：
- 在整个应对过程中，企业应聘请专业的税务律师或法律顾问，为企业提供法律意见和指导。
若您是举报人（员工）：
明确后续流程与时间节点：
- 税务机关将在收到举报后的15个工作日内决定是否受理，并启动初步调查程序。
- 调查时间因案件复杂程度而异，您需耐心等待并关注调查进展。
积极配合税务机关调查：
- 提供真实、合法、关联的证据和信息来支持举报内容。
- 接受税务机关的询问，并如实陈述所知情况。
了解并维护举报人权益：
- 您的个人信息将受到严格保护，税务机关将确保您的隐私不被泄露。
- 如果举报内容属实，且为实名举报，您可能会获得一定的奖励或表彰。
- 对处理结果不满意的，您可以在规定时间内向上一级税务机关申请行政复议，或直接向人民法院提起行政诉讼。
综上所述，无论是企业还是举报人，都应遵循法律法规，积极配合税务机关的调查和处理工作。企业应加强内部管理，防止类似问题的发生；举报人则应了解相关法律法规和举报处理流程，以维护自身权益和税收秩序。