专利纠纷可以由多个部门处理，具体取决于纠纷的性质和阶段。以下是从不同角度对处理专利纠纷部门的详细分析：

1. 国家知识产权局（或地方知识产权局）：

   • 职责：国家知识产权局是负责专利审批和管理的国家机构，地方知识产权局则负责具体执行和区域管理。在专利纠纷中，它们主要负责处理专利无效宣告请求、专利权属纠纷等行政程序。
   • 适用情况：当一方认为某专利不应被授予或存在权属争议时，可以向国家知识产权局或地方知识产权局提出无效宣告请求或权属纠纷处理申请。

2. 人民法院：

   • 职责：人民法院是司法机关，负责审理各类民事、刑事和行政案件。在专利纠纷中，它们主要负责审理专利侵权纠纷、专利合同纠纷等民事案件，以及涉及专利的刑事案件。
   • 适用情况：当专利权被侵犯或专利合同发生争议时，专利权人或相关方可以向人民法院提起诉讼，寻求司法救济。

3. 专利复审委员会（现已并入国家知识产权局专利局复审和无效审理部）：

   • 职责：虽然专利复审委员会的名称已有所变更，但其核心职能——处理专利无效宣告请求——仍然存在。该部门负责审查无效宣告请求，并作出决定。
   • 适用情况：与国家知识产权局处理无效宣告请求的程序相似，但更侧重于对无效宣告请求的实质审查。

4. 仲裁机构：

   • 职责：仲裁机构是独立于行政机关和司法机关的第三方机构，负责根据双方当事人的仲裁协议，对专利纠纷进行仲裁。
   • 适用情况：当双方当事人在专利合同中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，且纠纷属于可仲裁范围时，可以向仲裁机构申请仲裁。

5. 市场监管部门（如知识产权局下属的市场监管支队）：

   • 职责：市场监管部门在专利纠纷中主要扮演执法者的角色，负责查处假冒专利、专利侵权等违法行为。
   • 适用情况：当发现市场上存在假冒专利或专利侵权行为时，可以向市场监管部门举报，由其进行调查和处理。

在处理专利纠纷时，建议根据纠纷的性质和阶段选择合适的部门。例如，对于专利无效宣告请求，可以选择向国家知识产权局或专利局复审和无效审理部提出；对于专利侵权纠纷，可以选择向人民法院提起诉讼或向市场监管部门举报；对于专利合同纠纷，如果双方有仲裁协议，也可以选择向仲裁机构申请仲裁。

此外，无论选择哪个部门处理专利纠纷，都建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为专注于知识产权、专利权领域的律师，我能够为你提供全面的法律咨询和帮助。如果你有任何关于专利纠纷的问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。