专利侵权主要由国家知识产权局、地方管理专利工作的部门以及人民法院来处理，特定情况下海关等部门也可能参与。以下是详细介绍：

1. 国家知识产权局及地方管理专利工作的部门

   • 职责与权限：国家知识产权局负责全国范围内的专利管理工作，包括专利侵权行为的查处。地方管理专利工作的部门（如各省、自治区、直辖市的知识产权局）则负责本行政区域内的专利管理工作。这些部门有权对专利侵权行为进行调查取证，认定侵权行为是否成立，并根据情况作出责令停止侵权行为、没收违法所得、罚款等行政处罚措施。同时，它们还可以就侵犯专利权的赔偿数额进行调解。
   • 处理程序：专利权人或利害关系人认为其专利受到侵犯时，可以向管理专利工作的部门提出处理请求，并提交相关证据材料。管理部门在收到请求后，会进行审查并立案，随后展开调查取证工作。根据调查结果，管理部门会组织双方当事人进行调解或审理，并依法作出处理决定。

2. 人民法院

   • 职责与权限：人民法院是国家的审判机关，负责审理各类民事、刑事和行政案件，包括专利侵权纠纷案件。在专利侵权诉讼中，人民法院有权对案件的实体问题进行全面审查和判断，确定被告是否构成侵权，以及如何承担侵权责任。例如，在一些复杂的专利侵权案件中，涉及到技术特征的对比、等同原则的适用等专业问题，人民法院会通过专业的审判团队和技术鉴定等手段，准确认定侵权事实。
   • 处理程序：专利权人或利害关系人向人民法院提起诉讼，提交起诉状和相关证据材料。人民法院对起诉进行审查，符合受理条件的予以受理，并向被告送达起诉状副本等材料。随后，法院安排开庭时间，组织双方当事人进行法庭调查和辩论，查明案件事实。根据审理结果，法院作出判决。如果被告不履行判决义务，原告可以申请法院强制执行。

3. 其他特定机构（以海关为例）

   • 职责与权限：海关主要负责监管进出境的货物、物品等，防止侵犯知识产权的货物进出口。对于涉嫌侵犯专利权的进出口货物，海关可以依职权或者根据权利人的申请采取扣留等措施。例如，当权利人发现有侵犯其专利权的货物即将进出口时，可以向海关提出扣留申请，并提供相关证据。海关在审核通过后，会依法扣留该批货物，并进行调查核实。
   • 处理程序：权利人可以向海关总署申请知识产权备案，以便海关在监管过程中能够及时识别涉嫌侵权的货物。在发现有涉嫌侵权货物进出口时，权利人及时向海关提出申请，并提供担保。海关扣留货物后，会进行调查核实。如果确认货物侵犯了专利权，海关将依法进行处理，如没收侵权货物等。

建议：

• 如果专利权人希望通过较为快速、简便的行政途径制止侵权行为，且对赔偿数额要求不高或愿意通过调解解决，可以选择向知识产权管理部门投诉。
• 如果专利权人希望获得全面的民事赔偿，或者对赔偿数额、侵权判定等问题存在较大争议，向法院起诉可能是更合适的选择。因为司法途径可以提供更为严谨和权威的裁决，确保专利权人的合法权益得到充分保护。

在处理专利侵权问题时，专利权人应根据具体情况选择合适的维权途径。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。