违法运输危险废物的查处部门主要是生态环境主管部门和交通运输主管部门，具体分工如下：

1. 生态环境主管部门：

   • 根据《中华人民共和国固体废物污染环境防治法》的相关规定，生态环境主管部门对危险废物的收集、贮存、运输、处置等全过程负有监管职责。
   • 在违法运输危险废物的情况下，生态环境主管部门有权进行查处，包括责令停止违法行为、限期改正、罚款等行政处罚措施。
   • 如果违法运输行为造成了环境污染，生态环境主管部门还可以要求违法者承担环境修复责任，并可能追究其刑事责任。

2. 交通运输主管部门：

   • 交通运输主管部门负责道路运输市场的监管，包括危险货物运输的许可、车辆和驾驶员的资质审核等。
   • 在违法运输危险废物的情况下，如果涉及未经许可擅自运输、使用不符合规定的车辆运输等违法行为，交通运输主管部门也有权进行查处。
   • 交通运输主管部门可以采取责令停止运输、罚款、吊销相关许可证件等行政处罚措施。

在实际操作中，两个部门可能会根据具体情况进行联合执法：

• 当发现违法运输危险废物的行为时，生态环境主管部门和交通运输主管部门可能会共同介入，进行联合调查和处理。
• 联合执法可以更有效地打击违法运输行为，确保危险废物得到安全、合规的处理，防止环境污染和安全事故的发生。

法律建议：

• 如果你发现有人违法运输危险废物，可以向当地的生态环境主管部门或交通运输主管部门举报。
• 作为运输企业或个人，应严格遵守相关法律法规，确保危险废物的运输符合安全、环保等要求，避免违法行为的产生。

可能后果：

• 违法运输危险废物可能会面临严重的法律后果，包括行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。
• 因此，务必重视危险废物的运输管理，确保合法合规。

如果你在交通运输领域遇到任何法律问题，或者对违法运输危险废物的查处有进一步的疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律解答和建议。