村书记收了承包工程的老板一万多元是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 若该款项属于正常经济往来或合法报酬：

   • 如果村书记收取的这一万多元是承包工程的老板按照合同约定支付的合法款项，比如工程款、材料款、劳务费等，且双方有明确的合同或协议作为依据，那么这种行为是合法的，不构成违法。
   • 例如，村书记作为村集体经济组织的代表，与承包工程的老板签订了施工合同，老板按照合同约定支付了部分工程款给村书记（或村集体账户，再由村书记进行分配），这种情况下收取款项是合法的。

2. 若该款项属于贿赂或非法利益输送：

   • 如果村书记收取的这一万多元是承包工程的老板为了获取不正当利益（如中标、顺利施工、减少监管等）而给予的贿赂，那么这种行为就构成了违法，甚至可能构成犯罪。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，国家工作人员利用职务上的便利，索取他人财物的，或者非法收受他人财物，为他人谋取利益的，是受贿罪。村书记作为基层组织人员，如果利用职务之便收受贿赂，同样会受到法律的制裁。
   • 例如，承包工程的老板为了确保自己能够中标村里的工程项目，私下给村书记送了一万多元作为“好处费”，这种情况下村书记收取款项就是违法的。

3. 若款项性质不明或存在争议：

   • 如果村书记和承包工程的老板之间对于这一万多元的性质存在争议，或者无法提供明确的合同或协议作为依据，那么这种行为就可能涉嫌违法或违规。
   • 在这种情况下，需要进一步的调查和证据收集来确定款项的性质和目的。如果调查结果显示款项确实存在违法或违规行为，那么村书记可能会面临法律责任。

法律建议：

• 对于村书记而言，应当严格遵守法律法规和职业道德规范，不得利用职务之便收受他人财物或谋取不正当利益。如果确实需要收取款项，应当确保款项的合法性和透明性，并留下明确的记录和证据。
• 对于承包工程的老板而言，应当遵守法律法规和商业道德，不得通过行贿等不正当手段获取利益。如果与村书记之间存在经济往来，应当确保往来款项的合法性和合规性，并保留好相关证据。
• 如果双方对于款项的性质或目的存在争议或疑问，建议及时咨询专业律师或相关机构进行法律评估和风险防范。

可能后果：

• 如果村书记收受贿赂的行为被查实，可能会面临刑事处罚（如受贿罪）和行政处罚（如开除公职、罚款等）。
• 如果承包工程的老板存在行贿行为，同样可能会面临刑事处罚（如行贿罪）和行政处罚（如罚款、吊销营业执照等）。

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