针对公司员工拿走公司财物价值一万多元的情况，这属于职务侵占或盗窃行为，公司应当立即采取法律措施维护自身权益，具体处理方式如下：

1. 内部处理：

   • 调查核实：公司应首先通过内部调查，核实员工拿走财物的具体事实，包括时间、地点、财物种类及价值等，确保有充分的证据支持。
   • 纪律处分：根据公司的规章制度，对涉事员工进行相应的纪律处分，如警告、记过、解雇等。若公司规章制度中有明确规定此类行为的处理方式，应严格按照规定执行。
   • 要求返还：向涉事员工发出正式通知，要求其立即返还所拿走的财物，并明确告知其行为的违法性和可能面临的法律责任。

2. 法律途径：

   • 报警处理：若员工拒绝返还财物或公司认为其行为已构成犯罪，应立即向当地公安机关报案，提供相关证据材料，要求追究员工的刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，盗窃公私财物，数额较大的，可处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。
   • 民事诉讼：除了刑事责任外，公司还可以选择向法院提起民事诉讼，要求涉事员工赔偿因拿走财物而给公司造成的经济损失。在民事诉讼中，公司需要提供充分的证据证明员工的侵权行为及损失金额。

3. 预防措施：

   • 完善制度：公司应进一步完善内部管理制度，明确员工的行为规范和责任，加强对公司财物的保护和管理。
   • 加强教育：定期对员工进行法律教育和职业道德培训，提高员工的法律意识和道德水平，减少类似事件的发生。
   • 安装监控：在公司重要区域安装监控设备，以便在发生类似事件时能够迅速查明事实真相。

在处理此类事件时，公司应保持冷静和理性，依法依规进行处理，避免采取过激行为或侵犯员工合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。