工厂请假一天扣三天工资的做法是不合法的，以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是保障劳动者获得应得报酬的基本法律原则，工厂因员工请假一天而扣除三天工资，显然违反了这一原则。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条第一款：规定用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这进一步强调了用人单位支付工资的义务和责任，工厂不得随意扣除劳动者工资。
《工资支付暂行规定》：也强调了用人单位在扣除员工工资时必须合理、合法，且需事先有明确规定。请假一天扣三天工资的做法，显然缺乏合理性和合法性。
二、具体分析
扣款合理性：劳动者为用人单位提供劳动以获取报酬，请假仅是劳动者在特定时间内未能提供劳动。因此，正常情况下应按照请假的实际时长（如小时或天数）结合劳动者的日工资或小时工资标准进行相应扣除。请假一天扣三天工资，超出了合理范围，属于不合理的克扣工资行为。
公平合理原则：从公平合理的角度出发，任何对劳动者工资的扣除都应基于实际未提供劳动的时间，并进行合理计算。成倍扣除工资的做法，违背了这一基本原则，也损害了劳动者的合法权益。
三、维权途径
面对工厂不合理扣工资的情况，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：
协商沟通：首先与用人单位进行协商，要求其按照正确的工资计算方式支付工资。在协商过程中，劳动者可以明确指出工厂的做法违反了相关法律法规，并要求工厂立即纠正。
投诉举报：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉举报，请求其依法介入处理。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理，并保障劳动者的合法权益。
劳动仲裁：如果问题仍未得到解决，劳动者可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。劳动仲裁机构将依法对争议进行裁决，并保障劳动者的合法权益得到实现。
提起诉讼：对仲裁结果不满意的，劳动者还可以向法院提起诉讼，进一步寻求法律救济。法院将依法对案件进行审理，并作出公正的判决。
四、举例说明
假设某工厂员工小李的日工资为200元，他因个人原因请了一天假。如果工厂按照请假一天扣三天工资的规定，将扣除小李600元工资。然而，根据相关法律法规，工厂只能扣除小李当天的工资200元。因此，工厂的做法显然是不合法的，小李有权通过上述维权途径维护自己的合法权益。
综上所述，工厂请假一天扣三天工资的做法不仅违反了法律法规，也违背了公平合理的原则。劳动者在面对此类情况时，应依法维权，确保自己的合法权益得到保护。如果你还有其他关于劳动纠纷的问题，可以直接向我咨询。