若不同意鉴定样本，可采取以下措施，具体需结合实际情况选择适用方案：

1. 明确提出书面异议并说明理由
   若对鉴定样本的真实性、合法性或关联性存疑（例如样本被污染、来源不明、与案件无关等），应在收到鉴定意见后法定异议期内（通常为10-15日，具体以鉴定机构通知为准）向鉴定机构提交书面异议，详细说明反对理由及依据。例如，若样本为生物检材，可要求提供采集、保存、运输环节的全程记录以证明无污染；若样本为书面材料，可指出签名伪造、内容篡改等疑点。

2. 申请重新鉴定或补充鉴定
   根据《司法鉴定程序通则》第三十一条，若存在鉴定程序违法、样本不足、鉴定人资质不符等情形，可向原鉴定机构或上级司法行政部门申请重新鉴定。例如，若首次鉴定仅使用部分样本，可要求补充剩余样本进行全面分析；若鉴定人未回避利益冲突，可主张程序违法要求重鉴。
   补充说明：重新鉴定需提供充分证据证明原鉴定存在瑕疵，否则可能被驳回。

3. 通过诉讼程序质疑鉴定效力
   若鉴定意见已作为证据提交法庭，可在庭审中通过质证环节提出异议，要求鉴定人出庭接受询问（《民事诉讼法》第八十二条）。此时需准备反驳证据（如专家辅助人意见、其他鉴定机构对比结论等），重点攻击鉴定样本的“三性”（真实性、合法性、关联性）。例如，若样本为电子数据，可申请调取原始存储介质以证明未被篡改。

4. 协商更换样本或终止鉴定
   若双方对样本争议无法调和，可与对方协商更换样本（如用其他时间、地点的检材替代）或终止鉴定（需签订书面协议明确责任划分）。例如，在亲子鉴定中，若一方拒绝提供血样，可协商改用毛发、指甲等替代样本，但需确保替代样本的DNA含量足够。

风险提示：

• 异议需在法定期限内提出，逾期可能丧失权利；
  
• 重新鉴定费用通常由提出方预交，最终由败诉方承担；
  
• 恶意否定样本可能导致证据效力被排除，需谨慎评估风险。
  

若有具体案件背景（如鉴定类型、争议焦点等），可进一步提供细节，我会结合实务经验为您定制应对方案。