结论前置：根据《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例，以及《政府采购非招标采购方式管理办法》等相关法律法规，政府采购法实施条例中规定的履约保证金不予退还的情形主要包括中标人或承包人存在违约行为，如未履行或未完全履行合同、工期延误、擅自转包或分包、中途擅自终止合同等，以及招标人或发包人基于非法目的没收保证金等。以下是对这些情形的详细分析：
一、中标人或承包人方面的违约行为
未履行或未完全履行合同：
- 中标人或承包人未按照合同约定履行义务，如工程建设中的质量问题、货物买卖合同中的货物不符合约定等，均构成违约。在此情况下，招标人或发包人有权根据合同约定或法律规定，不予退还履约保证金。
- 具体案例：在桥梁建设项目中，如果承包人使用了不符合标准的钢材，导致工程存在质量隐患，招标人或发包人可以依据合同约定，不予退还履约保证金，并要求承包人承担相应的赔偿责任。
工期延误：
- 在对履行期限有明确要求的合同中，如因承包人自身原因未能按时完成工程或按时返还租赁物，构成违约。招标人或发包人有权根据合同约定，不予退还履约保证金。
- 法律后果：工期延误不仅可能导致履约保证金不予退还，还可能使承包人承担额外的违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
擅自转包或分包：
- 在禁止转包、分包的合同中，承包人未经同意擅自将工程转包或违法分包，发包人有权不退还履约保证金。
- 法律后果：擅自转包或分包不仅可能导致履约保证金不予退还，还可能使承包人面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。
中途擅自终止合同：
- 合同履行过程中，中标人或承包人无正当理由擅自终止合同履行，履约保证金通常不予退还。
- 法律后果：中途擅自终止合同不仅可能导致履约保证金不予退还，还可能使承包人承担违约责任，如赔偿招标人或发包人的损失等。
提出附加条件或更改合同实质性内容：
- 中标人在签订合同时向招标人提出附加条件，或试图更改合同的实质性内容，视为违约行为。招标人或发包人有权根据合同约定，不予退还履约保证金。
- 法律后果：提出附加条件或更改合同实质性内容不仅可能导致履约保证金不予退还，还可能使中标人失去中标资格，并面临行政处罚。
二、招标人或发包人方面的非法行为
- 基于非法目的没收：
- 招标人或发包人没有合法依据，如滥用权力、恶意刁难等，随意决定不退还履约保证金，是不合法的。中标人可以通过法律途径要求退还。
- 法律救济途径：当中标人认为招标人或发包人非法没收履约保证金时，可以向法院提起诉讼，要求退还保证金并赔偿损失。
三、其他相关情形
未及时承担违约责任：
- 履约保证金作为中标人承担违约责任的担保，如果中标人没有及时承担违约责任，履约保证金可作为招标人损失的弥补。在此情况下，招标人或发包人有权不予退还履约保证金。
损失超出保证金金额：
- 若中标人给招标人造成的损失超过履约保证金数额，中标人还应当对超过部分予以赔偿。在此情况下，即使履约保证金被全部扣除，中标人仍需承担额外的赔偿责任。
四、法律依据与处理途径
- 法律依据：根据《中华人民共和国招标投标法》第六十条、《中华人民共和国招标投标法实施条例》第三十五条、第七十四条，以及《政府采购非招标采购方式管理办法》第二十条等相关规定，履约保证金的退还与否需综合考虑合同双方的履行情况、合同约定以及相关法律法规的规定。
- 处理途径：对于履约保证金的退还存在争议时，当事人应通过协商、仲裁或诉讼等合法途径解决。在协商无果的情况下，可以向仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
综上所述，政府采购法实施条例中规定的履约保证金不予退还的情形主要包括中标人或承包人存在违约行为以及招标人或发包人基于非法目的没收保证金等。在实际操作中，双方应严格遵守合同约定和相关法律法规的规定，确保合同的顺利执行和履约保证金的正确处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。