若扣押车辆被申请人拒绝退还，申请人可按照以下手续和步骤来维护自身权益：

1. 确认扣押合法性及程序完整性

   • 首先，申请人需确认自己对车辆的扣押行为是否合法，例如是否基于有效的法律文书（如法院裁定、行政机关决定等）或合同约定（如质押合同）。
     
   • 若扣押行为本身存在程序瑕疵（如未依法送达通知、未履行必要手续等），被申请人可能以此为由拒绝退还，此时申请人需先补正程序或通过法律途径确认扣押效力。

2. 与被申请人协商或发送书面催告

   • 申请人可先尝试与被申请人协商，明确要求退还车辆，并保留书面沟通记录（如邮件、短信、律师函等）。
     
   • 若协商无果，可委托律师向被申请人发送《退还车辆催告函》，载明扣押依据、退还要求及逾期不退还的法律后果，为后续诉讼或强制执行提供证据。

3. 申请法院强制执行（若扣押基于生效法律文书）

   • 若扣押是法院裁定或判决的结果：申请人可直接向法院申请强制执行，法院会依法采取查封、扣押、拍卖等措施，并责令被申请人退还车辆。
     
   • 若扣押是行政机关决定：申请人可申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销违法决定或确认扣押合法，再依据生效文书申请强制执行。

4. 提起民事诉讼（若扣押基于合同或侵权）

   • 合同纠纷：如因质押、租赁等合同关系扣押车辆，被申请人拒绝退还的，申请人可起诉要求返还车辆并赔偿损失。
     
   • 侵权纠纷：如被申请人非法扣押车辆（如私力救济过度），申请人可起诉要求停止侵害、返还车辆并赔偿损失。
     
   • 诉讼中申请财产保全：为防止被申请人转移车辆，申请人可在起诉时或诉讼中申请法院对车辆采取保全措施。

5. 报警处理（若涉嫌刑事犯罪）

   • 若被申请人拒绝退还车辆的行为涉嫌盗窃、抢劫、侵占等刑事犯罪（如车辆被非法占有且拒不归还），申请人可向公安机关报案，由公安机关立案侦查并追缴车辆。

注意事项：

• 整个过程中，申请人需保留所有与扣押、催告、协商相关的证据（如法律文书、沟通记录、车辆照片等），以支持后续主张。
  
• 若车辆已被转移或损毁，申请人可同时要求赔偿损失，并申请法院对被申请人的其他财产采取保全措施。
  

如有进一步疑问或需要具体操作指导，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况提供详细方案。