针对您提出的“公司的某些员工掌握着重要信息要离职该怎么处理”这一问题，这确实是一个需要高度重视且细致处理的环节，因为重要信息的泄露可能对公司造成不可估量的损失。以下是我为您提供的详细处理建议：
一、脱密期管理
设定脱密期：
- 根据公司实际情况和行业规定，为掌握重要信息的员工设定合理的脱密期。脱密期是指在员工离职前的一段时间内，对其在择业、出国（境）等方面采取限制措施，以确保重要信息不泄露。
脱密期内的管理：
- 在脱密期内，员工需继续履行保密义务，不得泄露公司重要信息。
- 公司应定期与员工沟通，了解其思想动态和离职后的去向，确保无泄密风险。
二、涉密载体清退
全面清退涉密载体：
- 员工离职前，必须清退所有个人所持有和使用的涉密载体，包括工作电脑、手机、U盘、移动硬盘等电子设备，以及涉密笔记本、文件、草稿纸、复印件等文件材料。
- 涉密电子设备需经专门销密处理，并办理清退移交手续；文件材料需逐页清点、密封销毁，严禁私自留存。
取消相关权限：
- 取消员工对涉密信息系统的访问权限和办公场所的出入权限，确保信息的安全。
三、签订保密承诺书
明确保密义务：
- 员工离职时，需签订保密承诺书，明确其离职后的保密义务和违反承诺应承担的法律责任。
- 保密承诺书应详细列出保密信息的范围、保密期限、保密措施以及违约责任等内容。
保密提醒谈话：
- 公司应对离职员工进行保密提醒谈话，告知其离职后的管理措施和保密要求，强调保密的重要性。
四、脱密期后的跟踪管理
定期报告情况：
- 在脱密期内，员工需定期向原单位报告个人就业变更、个人重大事项等情况，以便公司及时了解其动态。
特殊情况举报：
- 如员工在脱密期内遇到利诱、胁迫、渗透和策反等特殊情况，应及时向国家安全机关或公司举报，以便及时采取措施防止泄密。
五、法律与制度保障
遵守法律法规：
- 公司应严格遵守新修订的《中华人民共和国保守国家秘密法》等相关法律法规，确保涉密人员离职管理的合法性和有效性。
完善内部制度：
- 公司应建立健全内部保密制度，明确涉密人员的职责、权限和保密要求，以及离职管理的流程和措施。
六、应急处理机制
制定应急预案：
- 公司应制定涉密信息泄露的应急预案，明确应急处理流程、责任人和应对措施，以便在发生泄密事件时能够迅速、有效地进行处理。
加强培训与教育：
- 定期对员工进行保密培训和教育，提高员工的保密意识和技能水平，减少泄密风险。
综上所述，处理掌握重要信息的员工离职问题需要公司从多个方面入手，包括脱密期管理、涉密载体清退、签订保密承诺书、脱密期后的跟踪管理、法律与制度保障以及应急处理机制等。通过这些措施的实施，可以有效降低泄密风险，保护公司的核心利益和信息安全。