结论：公司用针孔摄像头拍的图片能否作为仲裁证据，需根据具体情况判断，主要取决于拍摄行为的合法性、证据的关联性以及是否侵犯他人合法权益等因素。以下从不同角度进行详细分析：

1. 拍摄行为的合法性：

   • 合法拍摄：如果公司是在合法、正当的场合下，如为了维护公司财产安全、防止盗窃等，在公共区域或员工知情并同意的情况下安装摄像头进行拍摄，且拍摄内容与案件事实直接相关，那么这些图片有可能被仲裁机构采纳作为证据。
   • 非法拍摄：如果公司未经员工同意，在私密场所（如更衣室、卫生间等）或通过非法手段（如偷拍、窃听等）获取图片，这些图片将因侵犯他人隐私权等合法权益而被视为非法证据，仲裁机构通常不会采纳。

2. 证据的关联性：

   • 即使拍摄行为合法，图片作为证据还需与案件事实具有直接关联性。如果图片内容无法证明案件中的关键事实，如工伤发生的经过、劳动关系的存在与否等，那么这些图片可能不会被仲裁机构视为有效证据。

3. 是否侵犯他人合法权益：

   • 仲裁机构在审查证据时，会考虑证据获取过程中是否侵犯了他人的合法权益。如果图片是通过侵犯他人隐私权、名誉权等合法权利的方式获取的，即使这些图片与案件事实有关，也可能因违法性而被排除。

4. 其他注意事项：

   • 证据的完整性：除了图片本身，公司还需提供其他相关证据来佐证图片的真实性、拍摄时间、地点等信息，以形成完整的证据链。
   • 仲裁规则：不同地区的仲裁机构可能有不同的仲裁规则和证据审查标准，公司在提交证据前应了解并遵守相关规定。

建议：

• 如果公司认为拍摄的图片对仲裁案件有重要作用，应确保拍摄行为合法、正当，并尊重员工的隐私权等合法权益。
• 在提交图片作为证据前，公司应仔细审查图片内容，确保其与案件事实直接相关，并准备好其他相关证据来佐证。
• 如果对图片的合法性或关联性存在疑问，公司可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。

可能后果：

• 如果公司提交的图片被仲裁机构认定为非法证据或无关证据，这些图片将不会被采纳，甚至可能影响公司对整个案件的举证和辩护。
• 如果公司因非法拍摄行为侵犯了员工的合法权益，还可能面临法律责任和声誉损失。

如有任何进一步疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。