在申请仲裁期间，公司是否继续赔偿取决于具体的工伤情况、公司的态度以及相关法律法规的适用，不能一概而论。以下从几个方面为你详细分析：
一、工伤认定与赔偿义务
工伤认定：首先，需要明确的是，只有经过工伤认定程序，被认定为工伤的，员工才有权享受工伤保险待遇，包括医疗费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金等。如果尚未完成工伤认定，或者认定结果尚未出来，那么公司是否赔偿以及赔偿的具体项目和金额都处于不确定状态。
赔偿义务：一旦工伤认定完成，且认定结果为员工因工受伤，那么公司就负有按照工伤保险条例和相关法律法规的规定，向员工支付相应赔偿的义务。这种义务是法定的，不因员工是否申请仲裁而改变。
二、申请仲裁期间公司的赔偿态度
主动赔偿：有些公司在工伤认定完成后，会主动与员工协商赔偿事宜，并按照协商结果或法律规定支付赔偿。这种情况下，即使员工正在申请仲裁，公司也会继续赔偿。
拒绝赔偿或拖延赔偿：然而，也有一些公司可能会拒绝赔偿或拖延赔偿，试图通过仲裁程序来拖延时间或减少赔偿金额。在这种情况下，员工需要通过仲裁程序来维护自己的合法权益。
三、仲裁程序对赔偿的影响
仲裁程序不影响赔偿义务：需要明确的是，仲裁程序本身并不改变公司的赔偿义务。无论仲裁结果如何，只要工伤认定完成且认定结果为员工因工受伤，公司就负有赔偿义务。
仲裁结果作为赔偿依据：仲裁程序的结果（即仲裁裁决）将作为公司赔偿的依据。如果仲裁裁决支持员工的赔偿请求，那么公司就需要按照裁决结果支付赔偿。如果公司不履行裁决，员工还可以向法院申请强制执行。
四、特殊情况下的赔偿
停工留薪期工资：在工伤治疗期间，员工享有停工留薪期工资。这是员工因工伤无法工作而应得的补偿，与是否申请仲裁无关。公司应当按照员工原工资福利待遇支付停工留薪期工资。
医疗费用：员工因工伤产生的医疗费用，应当由工伤保险基金支付。如果公司未为员工缴纳工伤保险，那么医疗费用应由公司承担。这与是否申请仲裁也无关。
五、建议与注意事项
及时申请工伤认定：如果发生工伤事故，员工应及时向公司报告，并尽快申请工伤认定。这是享受工伤保险待遇的前提。
保留相关证据：在工伤治疗期间和申请仲裁过程中，员工应保留好相关证据，如医疗记录、工资单、工伤认定决定书等。这些证据将有助于证明自己的工伤情况和赔偿请求。
咨询专业律师：如果员工在申请仲裁过程中遇到任何问题或困惑，可以随时向我咨询。我将根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总结来说，申请仲裁期间公司是否继续赔偿取决于工伤认定结果、公司的态度以及相关法律法规的适用。员工应了解自己的权益和义务，及时申请工伤认定并保留好相关证据。如有需要，可以随时向我咨询以获取专业的法律帮助。