判决书中案件由来部分一般不直接写“依法适用独任制审理”，但会在正文部分明确审理组织形式。具体分析如下：

1. 案件由来部分的核心内容
   案件由来主要阐述案件的起源、受理过程及基本事实，例如原告起诉时间、法院立案时间、案由等。其目的是让读者快速了解案件背景，而非直接说明审理程序。独任制或合议制的适用属于审理程序范畴，通常不在案件由来部分直接表述。

2. 审理组织形式的表述位置
   根据《人民法院诉讼文书样式》要求，审理组织形式（独任制或合议制）应在判决书正文部分明确。例如：

   • 独任制审理的案件，会在正文开头写明“本院依法适用简易程序，由审判员XXX独任审理”；
     
   • 合议制审理的案件，会写明“本院依法组成合议庭，由审判员XXX担任审判长，与审判员XXX、XXX组成合议庭审理”。

3. 特殊情况说明
   若案件由简易程序转为普通程序（独任制转合议制），或存在其他程序变更情形，法院会在判决书中详细说明程序变更的原因及时间节点，但此类内容仍属于正文部分，而非案件由来。

总结：案件由来部分无需直接写“依法适用独任制审理”，但判决书正文必须明确审理组织形式。若您对判决书结构或具体表述有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您详细解答。