退休公务员在职时违规的处理需根据违规性质、严重程度及是否已过追责时效等因素综合判断，具体处理方式如下：
行政处理
若违规行为属于违反《公务员法》《行政机关公务员处分条例》等规定的情形（如贪污受贿、滥用职权、玩忽职守等），即使公务员已退休，仍可能被追责。根据《行政机关公务员处分条例》第五十二条，公务员退休后发现其在职期间有违法违纪行为且应受处分的，不再给予处分，但应撤销其退休待遇（如退休金、补贴等），并按照规定收缴其违法违纪所得。若违规行为构成犯罪，则依法移送司法机关处理。
刑事追责
若违规行为涉嫌犯罪（如受贿罪、贪污罪、滥用职权罪等），根据《刑法》第八十七条关于追诉时效的规定，若犯罪行为未超过法定追诉期限（如法定最高刑为不满五年有期徒刑的，追诉期为五年；法定最高刑为十年以上有期徒刑的，追诉期为十五年等），仍可追究刑事责任。退休公务员与在职公务员在刑事责任上无本质区别，需承担相应的刑罚（如有期徒刑、罚金等）。
民事赔偿
若违规行为导致国家或他人财产损失（如违规决策造成公共资金损失），退休公务员可能需承担民事赔偿责任。根据《民法典》相关规定，若其行为与损害结果存在因果关系，需在个人财产范围内赔偿损失。若在职期间单位已通过内部程序追偿，退休后仍可能被要求补充赔偿。
纪律处分与声誉影响
即使不涉及行政处分或刑事追责，退休公务员的违规行为仍可能被记录在个人档案或廉政档案中，影响其退休后的社会评价及参与社会活动的资格（如担任企业顾问、行业协会职务等）。此外，若违规行为被公开通报，可能对其个人声誉造成长期负面影响。
建议：若涉及具体案件，需结合违规行为的具体情节（如金额、后果、主观故意等）、证据充分性及追责时效等因素综合分析。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业法律意见。