交通事故和解协议签订后，检察院仍可能起诉，但需分情况讨论：

1. 和解协议不影响刑事责任追究的情形
   若交通事故构成交通肇事罪（如致人重伤、死亡或重大财产损失，且驾驶人存在酒驾、逃逸等法定加重情节），即使双方签订了民事和解协议，检察院仍可依法提起公诉。刑事责任与民事赔偿是独立法律关系，和解协议仅能解决民事赔偿部分，无法免除刑事处罚。此时，和解协议可能作为量刑情节（如认罪认罚、积极赔偿）被法院考虑，从而影响最终刑罚。

2. 和解协议可能终止刑事程序的情形
   根据《刑事诉讼法》第288条，若案件属于“民间纠纷引起的涉嫌侵犯人身权利、民主权利或财产权利的犯罪”，且可能判处三年以下有期徒刑，双方可自愿和解并签订协议。此时，检察院可依法作出不起诉决定（即“相对不起诉”）。但需注意：

   • 交通肇事罪通常不属于“民间纠纷”范畴，除非案件存在特殊情节（如因琐事争执引发）；
     
   • 即使符合和解条件，检察院仍需综合评估犯罪情节、社会危害性等因素，最终决定是否起诉。

3. 和解协议被撤销或无效的情形
   若和解协议存在法定无效情形（如一方欺诈、胁迫、显失公平），或赔偿未实际履行，受害方可能向检察院申请撤销和解，导致刑事程序重启。此时，检察院将根据新证据或事实重新审查是否起诉。

建议：

• 若您或对方已签订和解协议，但担心刑事风险，可主动向检察院提交和解协议、赔偿凭证等材料，争取不起诉或从宽处理；
  
• 若案件已进入公诉阶段，和解协议仍可作为量刑证据，建议委托律师与检察院沟通，强调赔偿情节对量刑的影响；
  
• 签订和解协议前，务必明确协议内容是否包含“刑事谅解”条款，并保留赔偿支付凭证，以备后续程序使用。
  

如有具体案件细节（如事故责任划分、伤亡情况、协议内容等），可进一步向我咨询，我将结合事实为您分析风险。