结论前置：单位没有按时发工资时，加班费的追溯时长需根据具体情况及当地法律法规来确定，通常受劳动仲裁时效和诉讼举证责任的影响。在职期间主张加班费不受一年仲裁时效限制，离职后应自劳动关系终止之日起一年内提出；两年内的加班费举证责任在用人单位，超过两年的部分由劳动者自行举证。
详细分析：
一、劳动仲裁程序及时效
一般规定：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果劳动者在一年内没有提出仲裁申请，可能会面临败诉的风险。
特殊情况：
- 劳动关系存续期间：如果劳动者还在职，那么他可以随时主张加班费，不受一年仲裁时效的限制。这是因为在职期间，劳动者的权益持续受到保护，且用人单位有义务及时支付劳动报酬。
- 劳动关系终止后：如果劳动者已经离职，那么他应在劳动关系终止之日起一年内提出加班费仲裁申请。这是为了促使劳动者及时行使权利，避免证据灭失或难以收集。
二、法院诉讼程序与举证责任
两年内的加班费：
- 根据《工资支付暂行规定》第六条，用人单位需保存两年以上的工资支付记录备查。因此，对于两年内的加班费主张，用人单位承担举证责任，证明已足额支付加班费。如果用人单位无法提供有效证据，那么法院可能会支持劳动者的主张。
超过两年的加班费：
- 对于超过两年的加班费，举证责任转移至劳动者。劳动者需要提供充分证据证明用人单位存在未支付加班费的情况，以及具体的加班事实和时长。由于时间久远，劳动者举证难度增加，如果没有有效证据，其主张可能得不到法院支持。
三、实际建议：
- 及时主张权利：无论在职还是离职，劳动者都应尽快主张自己的加班费权利，避免超过仲裁时效或举证困难。
- 保留证据：劳动者应妥善保留加班记录、工资单等相关证据材料，以便在需要时提供证明。这些证据可以是书面记录、电子数据、证人证言等。
- 了解当地规定：不同地区的司法实践可能存在差异，部分地区可能对时效期有特别规定或解释。因此，劳动者在主张加班费前，应了解当地的具体法律规定和时效要求。
四、举例说明：
- 假设小张于2021年1月1日入职某公司，工作期间经常加班但未获加班费。2023年6月1日离职后，他于2023年11月1日申请劳动仲裁主张加班费。在此情况下：
- 对于2021年11月1日至2023年6月1日期间的加班费，由公司承担举证责任。如果公司无法证明已足额支付加班费，那么小张的主张可能会得到支持。
- 对于2021年1月1日至2021年10月31日期间的加班费，小张需要自行提供证据。如果小张无法提供有效证据，那么他的主张可能得不到法院支持。
综上所述，主张加班费的追溯时长及举证责任均受法律明确规定。劳动者应根据自身实际情况和当地法律法规，及时有效地行使权利并保留相关证据。如果你有任何关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，都可以直接向我咨询。